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本研究于2007年从广东云浮地区分离和鉴定了一株猪繁殖与呼吸综合征病毒变异株,并对分离病毒的基因组序列进行了克隆和序列测定及遗传背景分析。试验对疑似为高致病性猪繁殖与呼吸综合征病猪的病料采集处理后,接种于易感细胞Marc-145细胞进行病毒培养,经过三代盲传,出现了典型的细胞病变,从病料中分离了一株PRRSV,命名为Yunfu07。本研究应用针对PRRSV的N基因的特异性引物Q1/Q2,通过RT-PCR技术对毒株进行检测,结果为阳性。试验对分离病毒进行了鉴定,病毒的TCID50为10-5.5/0.1mL;病毒为RNA病毒;Yunfu07株经56℃处理1小时后丧失对细胞的感染力;病毒培养的最佳pH值是6.8-7.2;病毒动物回归试验表明,分离毒株接种28日龄的仔猪,临床表现体温升高和一定程度的呼吸道症状。
试验参考VR2332和CH-1a株基因序列,设计了17对PRRSV的全基因序列引物,对Yunfu07株进行了RT-PCR扩增。试验对扩增出的基因片段进行克隆和序列测定,应用DNAstar生物学软件对所测得的序列进行处理后,结果显示Yunfu07株基因组全长15331bp。将Yunfu07株与VR-2332、Lelystad virus(LV)和其他11个分离株进行相似性比较,结果显示Yunfu07株与其它美洲型毒株的全基因组核苷酸序列相似性处于87.3%-98.7%之间,高于与欧洲毒株LV的相似性(仅为59.8%)。从而表明Yunfu07株属于美洲型毒株。序列分析表明,该毒株是一个天然存在缺失的变异毒株,与美洲型标准毒株VR-2332进行比较,共有39个氨基酸缺失。与高致病性PRRSV分离株一致的是,Yunfu07株的Nsp2有编码1个氨基酸的3个碱基缺失和编码29个氨基酸的连续87个碱基缺失。与GenBank上的其它PRRSV毒株相比,其ORF1a的Nsp2存在编码9个氨基酸的连续27个核苷酸的缺失。本研究结果补充和丰富了PRRSV毒株的基因组信息数据,为深入研究该毒株的遗传与变异及其与生物学特性的关系奠定了基础。