作为我国基础研究“国家队”以及国家创新体系的重要组成部分,联合型国家重点实验室(State Key Laboratory,简称SKL)已经成为我国组织开展高水平基础研究和前沿技术研究、聚集和培养优秀科学家、开展高水平学术交流的重要基地,在科学前沿探索和解决国家重大需求问题均做出了突出贡献。但我国联合型SKL发展不平衡,科技研究水平参差不齐,整体创新研究实力有限,在基础研究、应用基础研究方面的原始创新和集成创新能力有限,且不同类型的联合型SKL自主创新绩效差异显著。因此,有效地挖掘、发挥联合型SKL在项目、基地、人才方面的创新潜力和创新优势,选择合理的自主创新发展策略,对于不断提升我国联合型SKL的自主创新的科研实力、实现其健康、持续的良性发展具有重要作用。而发展策略的制定,必须以对其特定的内外部环境以及因素进行全面深入的分析为前提。首次运用SWOT研究法对我国联合型SKL进行了比较全面系统的分析。研究表明,我国联合型SKL在自主创新发展方面具有自身的优势(Strengths)和劣势Weakness)的同时,也必须要面临不同的威胁(Threat)和发展的机遇Weakness)。因此,发挥S-O、S-T、W-O、W-T四种策略的协调功能,成为提升我国联合型SKL自主创新的科研能力、实现其健康持续发展的应对之策。