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目的:利用基因芯片技术高通量地筛选胰腺癌细胞株Patu8988亲本株及对培美曲塞耐药细胞亚株之间的差异表达基因,建立胰腺癌细胞株对该药多药耐药发生中的总体基因表达改变图谱,以期获得胰腺癌细胞多药耐药发生机理的更多分子生物学信息,进一步探索胰腺癌细胞多药耐药发生的分子机制。
方法:用培美曲塞对人胰腺癌细胞株Patu8988进行药物诱导,通过MTT比色法检测胰腺癌细胞株Patu8988及其耐药亚株的耐药性。利用Affymetrix人类全基因组表达谱芯片Affymetrix U133 plus2.0 array分别对人胰腺癌细胞株Patu8988及耐药细胞亚株的基因表达谱进行检测,初步筛选耐药株与亲本株之间的差异表达基因。利用RT-PCR对芯片检测结果进行mRNA水平的验证,以确定芯片检测结果的可靠性。
结果:MTT实验显示培美曲塞对人胰腺癌细胞株Patu8988诱导后,人胰腺癌细胞株Patu8988的IC50较诱导前升高了2.7倍(P<0.05)。通过基因芯片技术检测胰腺癌细胞株Patu8988多药耐药发生中基因总体表达水平的改变情况。在所检测的47,400个转录本中,与亲本株相比,表达差异两倍以上同时具有统计学意义的转录本共有1,890个,表达上调的基因1,276个,表达下调的基因197个。根据基因本体论注释,这些基因涉及不同的功能家族和生物学途径,包括细胞凋亡、细胞骨架及信号传导、细胞增殖、分化及周期调控、基因转录和翻译以及细胞物质与能量代谢等多方面。RT-PCR证实RFC,TS和FPGS的变化趋势与基因芯片结果一致。
结论:本研究成功地诱导了人胰腺癌细胞株Patu8988对培美曲塞产生获得性耐药,并应用含人类全基因组的表达谱芯片高通量地筛选出胰腺癌多药耐药发生中差异表达的基因,建立了胰腺癌细胞株Patu8988对于该药产生多药耐药中相关的基因表达改变图谱。