国有军工科研院所在发展过程中创办了一批市场化子公司，通过创办、经营子公司，不但较好的解决了已有科技成果的产业化问题，为科研院所带来了新的收入模式，还分流了部分科研人员，稳定了整体人才队伍。这些子公司一方面与母公司军品业务方面有着千丝万缕的联系，另一方面自成立之初这些公司就试图摆脱旧的计划经济体制，拥抱市场经济，因此也是最适宜进行混合所有制改革。　　××研究院是由XXXX集团公司根据战略发展规划将原有的五个研究所（其中四个研究所是国家财政部委托 XXXX集团公司管理的全额拨款事业单位）和一个工业公司合并组建而成。××研究院及其下属研究所和工业公司投资设立了十余家子公司，其中部分子公司已经引入了非公有制资本，未来××研究院将根据产业规划和混合所有制推进计划，逐步启动或加大引入其他非公有制资本，加大非公有制资本在相关子公司的股权比例。　　由于股权结构与股权管理模式会直接影响到公司治理模式。××研究院推行混合所有制改革工作对国有股权管理提出了严峻的挑战。通过实施科学有效的国有股权管理是提高国有军工科研院所对混合所有制子公司控制力和相关子公司执行力的重要管理手段。改进提升国有股权管理水平，不仅仅是国有军工科研院所集团化管理的有效手段，也是实现整体管理理念的提升。本文通过对××研究院实际调查，梳理分析了其股权投资管理、非公有制资本的引入和退出管理、国有股权相关权益管理、混合所有制子公司治理和股权风险管控等五个方面现状和存在的问题。　　在总结国内外学者已有的研究成果的基础上，本文试图从总体策略、管理流程、国有股权价值管理、混合所有制子公司治理和风险管控优等五个方面提出一定的优化策略，为××研究院混合所有制子公司国有股权管理工作提出了多角度的改进建议。希望通过本文的研究，能为××研究院改进混合所有制子公司国有股权管理工作提供帮助，提高对子公司的管控能力，同时对类似的国有科研院所对下属混合所有制子公司的国有股权管理工作提供一定的借鉴帮助。