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金针菇的子实体颜色有野生型黄色，浅黄色和白色．谢宝贵等人(2004)的研究指出，金针菇的子实体颜色受一对等位基因控制，黄色为显性，白色为隐性，与交配型因子A或B不连锁．金针菇黄色单核和白色单核相互杂交，子实体颜色呈浅黄色，且浅黄色间呈现一系列的过渡色．在部分食用菌中，一般认为异核体菌丝通过锁状联合这一细胞结构将两种核均匀分布到全部菌落，异核体中两种核的数量比例应该是1：1的关系；但金针菇原生质体单核化和粉孢子单核化过程中发生的核偏离的研究表明，异核体菌丝两种核的数量比例可能不是1：1的关系．本实验分两部分，一方面初步研究了浅黄色金针菇的一系列过渡颜色的遗传表达基础，另一方面尝试了浅黄色菌株中黄色核和白色核拷贝数的比例的确定。首先，本实验利用原生质体单核化技术从18个供试菌株中分离到了16种不同类型的黄色单核菌株和11种白色单核菌株。原生质单核化过程中，有9个供试菌株获得了两种亲本交配型单核菌株，9个菌株均只获得一种亲本交配型单核菌株．接着，选取13种黄色单核菌株和3种白色单核菌株进行出菇实验。有5种黄色单核菌株和2种白色单核菌株观察到单核子实体．其中，相同亲本同种交配型菌株出菇能力和单核子实体的颜色色系不表现差异，而不同基因型的菌株在出菇能力和单核子实体的颜色方面存在着一定的差异。不同基因型的黄色单核子实体在颜色色系和颜色分布上存在着多样性，说明控制金针菇黄色的因子存在着复等位基因．对黄色和白色的单核体材料进行了组合杂交实验。第一轮杂交，运用4个不同的白色单核菌株和14个不同黄色单核杂交，获得系列浅黄色杂合子菌株，用于出菇实验；第二轮杂交，运用5个能够获得单核子实体的不同黄色单核菌株与12个不同的白色单核菌株相互杂交获得杂合子菌株，用于出菇实验。两次的出菇实验结果均表明在环境条件基本一致的情况下，控制黄色的复等位基因是控制浅黄色过渡色形成的主要因素之一，同时，白色单核的遗传基因也在浅黄色过渡色形成过程中发挥着作用。另一方面，本实验利用FQ-PCR(teal-time fluorescent quantitative PCR)技术测定了34个浅黄色菌株中白色核数目占总的核数目的比值，其中有19个菌株白色核的拷贝数与黄色核的拷贝数接近于1：1的关系，15个菌株中黄色核的拷贝数要大于白色核的拷贝数。这个结果有待于进一步验证。