螺环乙酰乙酸内酯类抗生素氯丝菌素的生物合成机制研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hechangying1
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螺环乙酰乙酸内酯类抗生素具有广泛的生物活性,其中包括抗感染、抗肿瘤、抗疟疾和抑制胆固醇合成等。氯丝菌素(Chlorothricin,CHL)是螺环乙酰乙酸内酯类家族抗生素最具有代表性的分子之一,产生于Streptomyces antibioticusDSM40725,具有抗革兰氏阳性菌和胆固醇抑制活性。其分子由4-羟乙酰乙酸内酯与一个环己烯环形成的螺环,通过羧酸酯和一个反式十氢萘环相连接,最终构成独特的大环内酯骨架。其大环内酯骨架核心结构的形成可能包含了生物催化的Diels-Alder环化,Baeyer-Villiger氧化等罕见的酶催化反应。而其骨架的后修饰过程可能包含了生物催化的碳氢键连续氧化,糖基修饰,芳基氯化,甲基化等酶催化反应。碳氢键活化是有机化学合成的热点,氯丝菌素骨架侧链C-28位甲基的碳氢键如何在生物体内连续氧化引起了我们极大的兴趣。  本文拟通过对CHL生物合成相关基因的体内和体外实验研究,揭示生物体在温和条件下如何完成这一系列化学反应,同时阐明相关酶的催化功能和CHL生物合成机制。  P450氧化酶是生化研究的重点对象,具有催化羟化、环氧化和异构化等等众多反应的能力。我们推测CHL的C-28位甲基的氧化反应是由P450氧化酶负责催化的。因此,将一个推测的P450氧化酶ChlE2重新表达,得到了可溶性蛋白,CO结合实验证实ChlE2为P450氧化酶。体外活性测试证实ChlE2能催化CHL骨架侧链C-28位甲基连续氧化为羧基。体外测活实验还证实ChlE2能将含两个糖基,一个糖基和不带糖基的底物的C-28位甲基氧化,表明ChlE2对底物糖基化有很好的容忍性。相关底物结合常数实验以及酶学动力学测试表明:不带糖基的底物8-1D2G为三者中ChlE2催化最适合底物。通过ChlE2催化底物8-1D2G的反应进程曲线,推测底物通过反复进入蛋白活性中心最终完成甲基连续氧化。ChlE2分别和两个黄素依赖蛋白ChlEI、ChlE3的共催化实验表明:ChlE2催化氧化时不需要这两个蛋白的辅助。综合相关的体内数据,进一步明确了CHL生物合成后修饰途径。  对负责CHL前体的合成羧化酶基因chlJ和其伴侣基因chlI进行了体内研究。分别以单拷贝和多拷贝的方式分别将chlJ和chlIJ基因回补至chlJ基因敲除突变株,使得氯丝菌素恢复产生,证实了羧化酶ChlJ和氯丝菌素生物合成相关,同时表明其伴侣蛋白ChlI对CHL产量有一定影响。另外,通过对野生型菌株进行chlIJ单拷贝回补,大大提高了CHL的产量,表明通过羧化酶ChlJ基因表达从而增强前体供应的确能提高CHL的产量。  我们将Tetrocarcin A(TCA)生物合成基因簇中,一个高度同源的黄素依赖的氧化酶基因tcaE1体内异源回补至chlE3基因缺失突变株,结果氯丝菌素恢复产生。由于TCA分子骨架不是大环内酯结构,同时结合前期的chlE3基因体内实验结果和生物信息学分析,我们推测黄素依赖的氧化酶ChlE3可能负责特殊三碳单元掺入后的一步脱水反应,为聚酮长链D-A反应形成5,6-螺环提供双键。为验证此推测,我们尝试利用底物模拟物,探索特殊三碳单元的延伸机制。  糖基化和甲基化是螺环类抗生素生物合成途径中常见的后修饰反应,我们对糖基转移酶基因chlC7进行了同框敲除,对甲基转移酶基因chlB5进行了基因回补和表达实验。此外对两个调节基因chlF1和chlF2进行了体内回补实验。
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