肾透明细胞癌RNA m6A甲基化特征与预后的关系

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:gigitsang
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目的:RNA m6A甲基化调节因子可动态调节肿瘤发生和进展。但RNA m6A甲基化在肾透明细胞癌的作用尚未明确。本研究旨在分析肾透明细胞癌RNA m6A甲基化特征及其与临床特征和预后的相关性。方法:本研究分析了存在于癌症基因组图谱数据库的611个肾透明细胞癌样本中的23种RNA m6A调节因子与临床特征及预后的相关性。肾透明细胞癌肿瘤组织及癌旁正常组织中调节因子的m RNA表达水平的差异采用Wilcox秩和检验。对肿瘤组织中甲基化调节因子m RNA表达进行相关性检验,并计算pearson相关系数。进行一致性聚类分析判定是否可依据肿瘤组织中调节因子m RNA表达将肿瘤分型。进行主成分分析判定调节因子m RNA表达是否可代表肿瘤组织的m RNA表达特征。分析肿瘤分型与预后的关系采用KM生存分析并绘制生存曲线,并进行log-rank检验。分析肿瘤分型与临床特征的相关性,采用卡方检验比较分型间的临床特征差异。分析肿瘤组织中调节因子m RNA表达与预后的相关性,首先单因素Cox分析确定与预后相关的基因,然后通过Lasso回归构建Cox比例风险模型,并计算风险评分,以风险评分的中位值作为临界值,将患者分为高风险和低风险组。通过KM分析比较高低风险组之间的总生存率。通过受试者工作特征曲线的曲线下面积评估Lasso回归Cox比例风险构建模型预测价值。进行卡方检验评估高低风险组的临床特征差异。进行单因素和多因素Cox分析以选择影响总生存率的独立预测因子。结果:本研究发现多个RNA m6A甲基化调节因子的m RNA表达在与肾透明细胞癌肿瘤组织及癌旁正常组织间存在差异。肾透明细胞癌肿瘤组织中,RNA m6A甲基化调节因子的m RNA表达间存在一定的相关性。聚类分析显示可依据肾透明细胞癌肿瘤组织内RNA m6A甲基化调节因子的m RNA表达情况将肿瘤分型,且分型与临床特征及预后相关。以肾透明细胞癌肿瘤组织8种RNA m6A甲基化调节因子的m RNA表达情况构建的风险模型具有很好的预测价值,与临床特征相关,且是患者总生存率的独立危险因素。结论:肾透明细胞癌m6A RNA甲基化调节因子的m RNA表达特征与临床特征有关。8种RNA m6A甲基化调节因子的m RNA表达情况构建的风险模型计算出的风险评分可用于肾透明细胞癌患者总生存率的预测。
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