叶尔羌高原鳅Triplopysa yarkandensis（Day）,隶属鲤形目（Cyprinidformes）、鳅科（Cobitidae）、条鳅亚科（Nemachilinae）、高原鳅属（Triplophysa）、鼓鳔鳅亚属（Hedinichthys）,塔里木河水系特有鱼类,新疆维吾尔自治区Ⅱ级重点保护水生野生动物。本研究以和田河叶尔羌高原鳅为主要研究对象,通过连续周期性采样,分析其年龄与生长、繁殖等种群生态学特性,并在此基础上开展叶尔羌高原鳅塔里木河和叶尔羌河种群的个体生态学研究,比对不同河流叶尔羌高原鳅年龄及生长特性的种间差异,探究不同河流叶尔羌高原鳅的生存状况,进一步明确不同水域叶尔羌高原鳅差异特征,加强其种群动态和渔业生态平衡理论性研究,开展种质资源保护;通过鱼体形态学、耳石形态测量法、椭圆傅里叶分析法三种方法对和田河、塔里木河、叶尔羌河种群叶尔羌高原鳅开展种群判别,探究其种间差异,夯实了水生脊椎动物分类学基础,为高原渔业种质资源保护提供科学依据。主要结果如下:1耳石形态和年龄鉴定叶尔羌高原鳅微耳石近似椭圆形,中间较厚,逐渐向外边缘变薄,外侧面中央具明显突起。耳石长明显大于耳石宽,主间沟不明显,基叶发达,耳石腹部边缘较为光滑,呈浅弧形,耳石背部有波浪状突起,其耳石形态与叶尔羌高原鳅栖息海拔较高、生境温度低、栖息环境劣化（如盐碱度过高）、栖息深度浅等有关。采集1708尾叶尔羌高原鳅样本,确定微耳石为叶尔羌高原鳅年龄鉴定材料,年龄区间为1～7龄。确认叶尔羌高原鳅的假设首轮（平均耳石半径561.92±93.15 μm）为首轮。每年形成一个年轮,形成时间为10月到竖年4月。2生长特性较和田河种群,叶尔羌高原鳅塔里木河和叶尔羌河种群的体长、体重均值范围偏低,丰满度系数总体上表现出雄性略高于雌性。开展不同河流总体及雌雄种群的体长体重相关性拟合,比较b值与3的关系,确定叶尔羌高原鳅为匀速生长鱼类。计算不同河流总体及雌雄种群的生长方程、生长速度及生长加速度方程,和田河种群拐点年龄分别为9.0710龄、9.3252龄、9.3913龄。塔里木河种群拐点年龄分别为1.8295龄、1.2579龄、2.0544龄。叶尔羌河种群拐点年龄分别为3.9548龄、4.5011龄、3.9264龄。3繁殖特性和田河种群叶尔羌高原鳅雌雄比为0.87:1,繁殖期为3～5月,依据卵径分布及性腺成熟系数（GSI）,推测其属于同步产卵类型。依据Ⅳ～Ⅴ期雌鱼的怀卵量计算,绝对繁殖力（F）为 5973.42±6049.75 粒/尾,范围 674.95～23765.51 粒/尾;相对繁殖力（RF）为 317.02±375.97粒/g,范围11.78～1248.19粒/g;绝对繁殖力和体长、体重间存在显著线性关系,拟合方程分别为:FL=351.18L32774（R2=0.9316）、FW=581.18W-5616.9（R2=0.9549）。其繁殖特性的形成体现了叶尔羌高原鳅对栖息环境的适应性,不仅与自身特性相关,还受环境、营养状况等影响。4种群判别基于多变量形态度量学,对叶尔羌高原鳅3个地理种群的11个形态指标和22个框架指标进行多元统计分析。主成分分析显示,前3个主成分累计贡献率为48.30%,差异主要体现在机体头部和躯干前段;聚类分析显示,叶尔羌河种群与塔里木河种群先汇为一支,后与和田河种群汇为一支,即叶尔羌河种群与塔里木河种群形态差异较小,和田河较另外2个种群形态差异较大;构建判别方程并进行交互验证,综合判别率为88.37%,证明基于鱼体形态开展叶尔羌高原鳅不同地理种群的判定是可行的,尤其对成熟个体间,判别准确率显著升高至 99.00%。基于耳石形态学,对叶尔羌高原鳅3个地理种群的耳石信息进行统计分析。结果显示,采用耳石形态测量法和椭圆傅里叶分析法分别对3个不同地理种群叶尔羌高原鳅进行两两判别分析,和田河种群与塔里木河种群判别准确率分别为61.40%、82.20%,叶尔羌河种群与和田河种群判别准确率分别为79.50%、87.90%,叶尔羌河种群与塔里木河种群判别准确率分别为77.50%、86.80%,证明傅里叶分析法可作为叶尔羌高原鳅种群判别的有力工具,尤其对成熟个体间,判别准确率显著升高至100.00%。塔里木河水系的特殊性,造成不同河流生境中叶尔羌高原鳅种群存在鱼体形态和耳石形态差异,可通过多元分析对其进行有效区分,栖息环境的不同是引起机体形态学特征差异或适应进化的主要原因。本研究首次证明了傅里叶分析法在叶尔羌高原鳅种群判别中的有效性,尤其对成熟阶段的个体间识别。