雁形目鸟类12S rRNA基因和细胞色素b基因序列变异及其分子系统学研究

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiwang1998
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雁形目鸟类(Anseriformes)是一个种类繁多的类群,共150种左右,除南极大陆外,在世界范围内广泛分布。本文首先对雁形目鸟类的系统发生研究进行了综述,然后分别基于雁形目鸟类线粒体DNA 12S rRNA基因和细胞色素b基因全序列的遗传变异分析,探讨了雁形目鸟类分子系统发生。具体包括以下几个部分: 1、针对雁形目鸟类异常复杂的分类状况及分类上存在的争议,根据雁形目鸟类的形态学、行为学、骨骼学、角蛋白、线粒体与核DNA酶切片段长度多态、单拷贝核DNA-DNA杂交及线粒体基因DNA序列分析等方面的研究,对雁形目鸟类分类中科、亚科和族的划分及其相互间的系统发生关系进行综述,分析系统学研究中存在的不足,提出了雁形目鸟类分类中急需解决的问题。 2、研究测定了雁形目(Anseriformes)19种mtDNA 12S rRNA基因全序列,结合GenBank中雁形目种类相关数据,分析了雁形目36种鸟类12S rRNA基因序列变异及其分子系统发生。序列比对后约1030bp,含346个核苷酸变异位点,259个简约信息位点。研究结果表明:1)雁形目鸟类12S rRNA基因有较多的碱基插入和缺失,碱基转换数高于颠换数;2)赞同将鹊鹅(Anseranas)置于鹊鹅科(Anseranatidae)中,树鸭(Dendrocygna)应从雁亚科(Anserinae)中独立出来设立树鸭科(Dendrocygnidae),白背鸭(Thalassornis)隶属于树鸭科;3)鸭科(Anatidae)可分为雁亚科和鸭亚科(Anatinae)2个亚科,不赞同Sibley & Ahlquist(1990)设立天鹅亚科(Cygninae)及将麻鸭归入雁族(Anserini)的观点,支持Livezey (1996a,1997b)的观点建议将天鹅类归为雁亚科天鹅族(Cygnini),麻鸭置于鸭亚科下麻鸭族;4)在鸭亚科内的系统发生上,潜鸭最早分歧出来,麻鸭、海 中 文 摘 要鸭及栖鸭彼此IAJ的亲缘关系较近;河鸭族为一单系发生群,在系统演化中形成独立的一支。 3、研究测定雁形目鸟类 19 f+ mtDNA细胞色素 b基因全序列,结合 Genbank中的 4个物种,分析了雁形目鸟类细胞色素b基因的序列变异及其分子系统发生。细胞色素b基因序列变异分析表明:1)雁形目鸟类细胞色素b基因全序列长度一致,无插入和缺失:对照鸡线粒体密码子系统全序列能全部翻译成氨基酸序列,无无义突变,全序列内部无终止密码子;2)序列比对后1143加,含416个核着酸变异位点,306个简约信息位点,其中处于密码子第三位的变异最大,第一位和第二位碱基的变异相对较小。3)序列具有较高的转换/颠换比,基因序列中的转换与颠换都未饱和,序列中的碱基组成高度偏倚:4)按照细胞色素为蛋白结构模型,细胞色素b基因全序列可分为三个功能区,碱基替换饱和状况与不同功能区相关联。 系统发生分析表明:l)树鸭(DendroCygna)在雁形目鸟类系统演化中较早分歧出来,在分类上可以成立树鸭科;2)鸭科种类可以分为鸭亚科和雁亚科两大支。3)在鸭亚科中,河鸭族在系统演化中形成单独的一支,与鸭亚科其余各族的关系较远;潜鸭族、栖鸭族、海鸭族和麻鸭族彼此间的亲缘关系较近。4)在雁亚科内,雁属(*nser)和天鹅属(Cyg uns)均为单系发生,且互为姐妹群,支持雁亚科下设雁族和天鹅族。
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