【摘 要】
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本论文分为两部分,第一部分为miRNA的核酸组成与丰度分析;第二部分为明日叶的组织培养与快速繁殖。 第一部分:对于真核基因组和DNA片段的核酸组成与双核苷酸相对丰度的研究已
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本论文分为两部分,第一部分为miRNA的核酸组成与丰度分析;第二部分为明日叶的组织培养与快速繁殖。
第一部分:对于真核基因组和DNA片段的核酸组成与双核苷酸相对丰度的研究已经有许多报道,而针对microRNA(miRNA)的研究却很鲜见。为了能够发现新的miRNA单核苷酸和双核苷酸组成特点,我们计算了4274条成熟miRNA序列和4449条miRNA前体序列的核酸组成,同时计算了miRNA前体序列的双核苷酸丰度,并进行统计分析。结果显示,在从miRNA前体形成成熟miRNA的生物合成过程当中,植物与动物的核苷酸组成前后变化程度不同,但病毒的变化程度与动物相似。由这个结果可以推测,病毒miRNA从前体开始的生物合成过程与动物比较相似,而与植物差异较大,考虑到这些病毒皆为动物病毒,很可能是协同进化的结果。另外,我们发现,在miRNA前体序列中,普遍缺乏双核苷酸CpG,这可能与miRNA的表达有关。我们还发现,miRNA前体序列的双核苷酸丰度与序列的GC含量没有明显的相关性,这与在DNA片断中所存在的双核苷酸丰度与GC含量显著相关现象不同。除此之外,我们对不同物种的双核苷酸丰度的聚类分析和主成份分析表明,miRNA的双核苷酸丰度具有一定的分类学价值。
第二部分:原产于日本的明日叶(Angelica keiskei)是一种药食兼用的蔬菜,具有抗菌、补血、增强免疫力、促进成长和防癌等功效。但其果实为双悬果,种子发芽率较低,不易栽培,且关于它的组织培养与快速繁殖方法尚未见报道。于是我们在参考近缘中组织培养的基础上,采用梯度浓度培养基的方法,如使用不同浓度的植物激素进行培养等,分别筛选出适宜明日叶的芽诱导培养基、芽增殖培养基和生根培养基,最终成功摸索出了明日叶的组织培养方法。该方法可大大提高其繁殖系数,具有一定的潜在性应用前景。
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