基于28SrDNA和COI基因序列的蝗总科部分种类分子系统学研究

来源 :陕西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenrg210
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蝗总科是直翅目中分布最广的一个类群,是重要的农林害虫,具有十分重要的经济意义。关于蝗总科(Acridoidea)昆虫的科级分类一直是一个存在争议的问题,也是直翅目(Orthoptera)昆虫系统发育研究中的一个热点。虽然前人从形态学、细胞学、发音机制、分子生物学等角度对此作了研究,但是总体上研究的不够深入,依然存在许多分歧。本研究基于分子系统学方面对蝗总科7科15属35种昆虫的系统发育进行了探讨。采用PCR产物直接测序法测定了该35种昆虫的线粒体基因COI及核基因28SrDNA的部分片段序列,并以摩门螽蟖和变色乌蜢作为外群(28SrDNA构建的贝叶斯树以日本蚱和瘤脊蚱作为外群),采用CLUSTALX1.81、MEGA4.1、PAUP4.0及MrBayesV3.1等系统发育分析相关软件对序列进行了比对、碱基组成、碱基替换、遗传距离等分析,并通过碱基替换饱和性分析、gl及PTP检验等方法对序列进行了系统发育信号检测,结果显示所测定的序列具有较强的系统发育信号。采用最大似然法(ML)、贝叶斯推论法(BI)、最大简约法(MP)及邻接法(NJ)重建蝗总科7科部分种类的系统发育关系,得出以下结论:1.所研究昆虫线粒体COI基因序列中,碱基A+T,平均含量为65.5%(不含外群);碱基G+C,平均含量为34.5%(不含外群),表现出明显的A+T含量偏向性。核基因28SrDNA基因很保守,不含外群时,全部504个位点有339个保守位点,162个变异位点。其A+T含量只有30%,其中G的含量高达34.7%,这与线粒体基因之间存在着明显的区别。2.线粒体COI基因序列转换/颠换值平均为1.04,转换几乎等于颠换。在系统发育分析前对序列进行了替换饱和性分析,结果显示碱基替换没有明显的饱和趋势。碱基替换中转换的发生以T与C之间为主,颠换以T与A之间为主。核基因28SrDNA基因序列转换/颠换值平均为1.23,转换略大于颠换。碱基替换饱和分析显示转换和颠换的趋势线均为一条直线,说明28SrDNA基因不存在替换饱和现象,可以用于系统发育分析。3.33种蝗虫的COI基因的遗传距离在0.000-0.194之间,科间的遗传距离介于0.100-0.200之间。35种蝗虫的28SrDNA基因的遗传距离在0.000-0.019之间,科间的遗传距离介于0.000-0.100之间,可见序列相当保守。4.采用四种方法对线粒体基因COI、核基因28SrDNA以及COI&28SrDNA联合基因三个数据集分别构建MP、ML、NJ、BI树,比较它们之间的差异,结果表明所构建的树在拓扑结构上差异不大,简约法、距离法及似然法的拓扑结构基本一致,贝叶斯法构建的三个数据集的树基部均分为三支,构成并系,其余的拓扑结构基本和其他三种方法所建的树一致。5.根据各种系统发育树综合得出的结果如下:(1)槌角蝗科、网翅蝗科和剑角蝗科(中华蚱蜢除外)聚在一起,三科亲缘关系相对较近,这与传统的分类观点基本一致。我们所构建的几乎所有的分子系统树中,以红拟棒角蝗为代表的槌角蝗科与网翅蝗科中的华北雏蝗、辽宁雏蝗及黑翅雏蝗聚住一起,以日本鸣蝗和长白山金色蝗为代表的剑角蝗科也和网翅蝗科的部分种类聚在一起。(2)剑角蝗科在蝗总科进化过程中的位置不确定。剑角蝗科中的中华蚱蜢在几种系统发育树中,均没能和该科中的日本鸣蝗及长白山金色蝗聚在一起。(3)从所构建的分子系统树上看,癞蝗科与锥头蝗科有的聚在一起构成姊妹群,有的各形成一个单系群。(4)在我们所构建的分子系统树中,所有的斑腿蝗科种类聚在一起,形成一单系群,大多数的斑翅蝗科聚住一起形成单系群。本文是针对蝗总科7个科进行的一次较大规模的线粒体基因和核基因序列分析,该工作在一定程度上可为蝗总科的科级分类提供分子生物学方面的理论和实验依据,更加深入的研究还有待今后工作的充实和完善。在进一步的研究中,应增加样本的种类和数量,使分类单元更具代表性,同时延长序列的长度,使其包含更大的遗传信息。
其他文献
目的:总结急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿化学治疗过程中肝功能损伤的发生情况,探讨化疗等因素导致肝功能损伤发生的危险因素。方法:回顾性分析2015年6月至2017年6月于青岛大学
设计了一个数字化温度场测量系统,该系统可以对一维空间温度进行多点分布式数据采集,并对单总线系统通汛的可靠性进行了分析和实验。采用了数字集成温度传感器,具有测量误差小、
<正>基本案情师某某,A市经济技术开发区管委会副主任;屈某某,B置业有限公司法定代表人。2014年6月,师某某代表A市经济技术开发区管委会与B置业有限公司签订建设老年公寓项目
<正>烤鱼,一种发源于重庆万州的特色美食,在流传过程中,融合腌、烤、炖三种烹饪工艺技术,充分借鉴传统川菜及川味火锅用料特点,是口味奇绝、营养丰富的风味小吃。流行的川式
农村地区生活污水直排现象时有发生,氮磷污染极易造成水体富营养化。而在人工湿地中孔隙度较低的现有填料(土壤)很大程度上限制了水质净化效果,因此,积极开发多孔新型水处理陶粒,应用于人工湿地土壤基质改良,并以其为主要生物处理设施进行净化生活污水的研究,对湿地填料选择和应用推广具有重要意义。本文从填料自身的特性优化角度出发,以给水污泥为主要原料制备陶粒,研究了不同工况下陶粒性能变化情况,得出最佳工艺条件,
茶树[Camellia sinensis(L.)O.Kuntze]为多年生叶用植物,一年中新梢的多次采摘带走大量养分,氮是茶树中含量最高的矿质元素,也是茶叶中多种重要的有机物质组成成分,因而茶树对氮肥的需求量很高。本研究首先明确了茶树种质资源的一芽二叶、红梗绿茎着生叶、麻梗着生叶氮浓度、氮利用效率(Nitrogen Utilization Efficiency,NUtE)、红梗绿茎着生叶与麻梗着生
随着科学技术的发展,科技的应用,电磁干扰对电器使用的影响越来越大,电磁兼容在电器设计方面也日趋重要。电控设计在电器整体的电磁兼容EMC方面有重要的作用,本文浅谈电控板
支气管镜自1897年问世至今已有117年的历史。1897年,有"支气管镜之父"之称的德国科学家古斯塔夫.凯伦首先报道了用长25 cm,直径为8mm的食管镜为一名青年男性从气道内取出骨性异
“巴金、顾城、葛优、陈凯歌、陈丹青……”著名作家王安忆在她最新非虚构作品《今夜星空灿烂》里,以娓娓道来的细腻笔触为我们描绘了这一幅幅人物画像,这些遥远如星光文化名
文章介绍东千佛洞第二窟的卷草莲花纹,重点从莲花纹、卷草纹及赋色特点等方面对其审美特点进行解读,阐述了其雍容大度、自由生动的纹样形制和清冷色调完美结合的审美风格。