成都平原蜘蛛内生菌调查及青霉素酰化酶初步筛选

来源 :四川抗菌素工业研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jasongoes
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蜘蛛内生菌是潜在微生物资源库。在第三次生物催化浪潮来临之际,各种生物催化剂开发、利用的新思想、新技术、新方法层出不穷。以海洋,内生菌系统和极境微生物为三个代表的新资源领域日益引人注目,但蜘蛛及其内生菌资源研究开发显得滞后。本文正是在此背景下开展研究。本文以成都平原常见蜘蛛为研究对象,完成菌群筛查,比较各种属蜘蛛内生菌菌群概貌,证实不同种属蜘蛛内生菌的普遍差异性,并通过高通量测序对实验结果加以深化。实验产生2063个OTU,分布于27个门,60个纲,77个目,167个科,453个属。论文构建了棒络新妇蛛内生菌16S rDNA文库并进行了序列分型和聚类分析,证实产生青霉素酰化酶常见微生物属的存在。就文献检索结果而言,本文是迄今为止比较全面的蜘蛛内生菌分类学方面的研究。本文以成都平原蜘蛛常见种---棒络新妇(Nephila clavata)为材料,提取了蜘蛛内生菌宏基因组并构建了相应的宏基因组文库(库容接近15k,文库深度10倍以上)。采用简并寡核苷酸引物PCR(DOP-PCR)结合降落(TouchDown)方法筛选青霉素酰化酶核心序列片段。筛选到一段与Pseudomonas mosselii SJ10菌株编码的青霉素酰化酶部分同源的序列,新序列与已知序列在核苷酸水平一致度为85%;氨基酸水平一致度为88%。序列分析表明这是一种新型青霉素酰化酶。在核心序列基础上,论文设计热不对称交错PCR筛查整个矩阵文库期望获取靶酶全序列。本论文没有成功获得序列全长,研究需要进一步深入。
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