截止到2016年底，我国民营医院占我国医疗机构的总比近50％，民营医院为我国民众的医疗健康水平和医疗机构覆盖率都做出了巨大贡献。民营医院的药品收入占据了医院收入的40%到50%，药品在其整个企业发挥的作用不容忽视。所以对于营利性医院来说，药品管理环节的内部控制是医院内部控制的关键环节之一。　　本文首先通过文献研究总结整理了民营医院药品管理内部控制的相关理论，分析了S医院药品管理内部控制现状，进而对S医院药品预算、药品采购、药品入库、药品出库、库存管理、账务处理这几个关键环节设计调查指标，进行了问卷调查。然后根据问卷调查结果，进行分析，找出S医院药品管理内部控制各个重要环节管理上的优势和存在的问题。　　为解决S医院药品管理内部控制存在的问题，设计了第二轮调查问卷，依据COSO框架，从内部控制环境，风险评估，控制活动，信息与沟通，监督五个方面对药品管理内部控制有缺陷的环节进行了优化，从而加强对药品的管理。　　调查分析结果表明，以S医院为代表的民营医院的经营，普遍存在着一系列内部控制的问题。S医院药品管理内部控制管理水平不高，药品管理环节的内部控制要素缺失，管理环节的流程操作存在一定的缺陷，其中风险评估和监管环节是最为缺乏的。因为药品管理关乎到人民的生命安全，所以建议医院管理者应当以S医院为借鉴，对比参照自己所处的医院是否也存在相同的问题，对医院药品管理中存在的问题进行及时的控制和处理。