北美海蓬子耐盐相关基因的克隆与分析

来源 :华南热带农业大学 海南大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:yuhua345
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北美海蓬子(SalicorniaBigeloviiTorr.)属于藜科(Chenopodiaceae)、海蓬子属(Salicornia),是一种耐盐性极强的真盐生植物。其抗盐能力超过海水盐度的20%~40%,耐盐极限达到5%NaCl浓度,嫩茎中的可溶性盐分含量高达37%(干重百分比)。 植物Na+/H+逆向运输蛋白是一个跨膜运输蛋白,在植物耐盐性方面起着极为重要的作用。它负责将细胞质中的Na+排出胞外或者将细胞内的Na+运输到液泡内进行区隔化,从而降低了细胞质中的Na+浓度,使胞质中各种酶免受高Na+的毒害。对于北美海蓬子Na+/H+逆向转运蛋白基因的克隆以及进行结构与功能的分析,有利于在分子水平上详细了解该基因。将该基因转入到模式植物中,可以深入研究植物的耐盐机理以及该基因在植物耐盐中的重要作用。 本研究根据同源序列设计引物,通过RT-PCR方法从北美海蓬子中克隆出2591bp(GenBank登陆号为DQ157454)的Na+/H+逆向运输蛋白基因(NP)cDNA序列,该序列包括一段1683bp的开放读码框(openreadingframe,ORF),编码一条含560个氨基酸的多肽,推测分子量为62.1KD。系统发生(Phylogeny)分析表明该蛋白序列与质膜上Na+/H+运输蛋白亲缘关系较远,与细胞器上的Na+/H+逆向运输蛋白亲缘关系更近,说明北美海蓬子Na+/H+运输蛋白NP应当是在植物液泡膜上,负责将细胞质中Na+运输到液泡中,起离子区域化的作用,从而提高植物耐盐性。 将该基因编码区序列构建到植物表达载体pVKH-35S-pA上,通过农杆菌介导将基因转入到模式植物拟南芥(Arabidopsisthaliana)中。经过潮霉素抗性筛选和分离比筛选得到了转基因第三代(T3代)纯合子转基因植株。在200mmol/LNaCl胁迫下进行耐盐性分析表明,与野生型拟南芥相比,转基因植株耐盐能力得到了增强。说明了转入北美海蓬子Na+/H+逆向运输蛋白基因可以提高拟南芥的耐盐能力。 耐盐性是一个复杂性状,往往是由多个基因协同控制的。要想在整体水平上深入研究植物耐盐性,必须全面研究所有耐盐相关基因。为了分离北美海蓬子在盐胁迫下的一系列特异表达基因,进而鉴定这些基因在北美海蓬子耐盐过程中的作用,从而进一步弄清北美海蓬子耐盐机理。本研究利用SSH技术构建了北美海蓬子盐胁迫相关基因差减cDNA文库,分离到一批盐胁迫条件下特异表达的基因片段。 以播种于含0mmol/L的NaCl的液体MS基本培养基上的北美海蓬子幼苗总RNA(0号)和200mmol/LNaCl的液体MS基本培养基诱导24小时后的幼苗总RNA(2号)为模板,运用SMARTPCRcDNA合成技术分别合成全长cDNA。将两种cDNA群体进行抑制差减杂交,用T/A法分别构建正向差减文库(含205个克隆)和反向差减文库(含235个克隆)。采用PCR方法筛选正向差减文库获得138个重组子克隆,通过反向Northern斑点杂交筛选,得到在盐胁迫下特异表达的阳性差异片段克隆85个。对这些重组子的cDNA插入片段进行了序列测定,测序结果正常的克隆共81个,可以进行BLASTn分析。其中,有70个cDNA序列与已经报道的其它物种的核酸序列具有较高的同源性,可以推测其功能;另外11个cDNA序列未找到有较高相似性的已知序列,是未知基因。81个cDNA序列中没有与北美海蓬子中已报道的核酸序列有较高的相似性,因此,所有81个克隆序列都是新基因。
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