黄花杓兰 (Cyptipedium flctvum),兰科 (Orchidaeaea) 杓兰属 (Cypripedium)植物,为我国特有植物,分布于云南西北部、西藏东南部、四川、甘肃南部和湖北西部的高海拔地区,是一种典型的多年生高山草本植物.近年来,由于人为破坏及自身繁殖困难等原因导致居群数量急剧下降,急需探明黄花杓兰的濒危机制并发展有效的保护策略.论文的主要研究目的在于采用 AFLP 分子标记方法对云南省中旬分布的黄花杓兰居群进行研究,通过研究居群的遗传多样性水平、遗传结构及克隆多样性、克隆空间结构,探讨有性和无性两种繁殖方式的相对比例,揭示黄花杓兰的繁殖策略和遗传变异程度,进而为杓兰的物种保护提供理论依据. 本研究利用 AFLP 分子标记对黄花杓兰在云南中甸的 6 个自然居群共 121 个个体进行分析得到以下结果:两组引物共产生 104 个位点,其中 86 个为多态位点,多态位点百分率为 82.69﹪.黄花杓兰具有丰富的遗传变异(物种水平上,He=0.2884,Ho=0.4312；居群水平上,P=64.59﹪,He=0.2449,.Ho=0.3606).其中,小中甸 (He=0.2618)和天生桥 (He=0.2610)居群的Nei的基因多样性系数较高,仙人洞(He=0.2237)最低.黄花杓兰居群的遗传分化不大(Gst=0.154),居群间基因交流较为频繁(Nm=2.7460). 选择天生桥和五凤山居群作克隆多样性及克隆空间结构的分析.采用样方法(10×16 m<2>)取样,在每格1m<2>的正方形的四个顶点取样,分别采集样品94个和44个,共138个个体.AFLP 分析结果为:居群的克隆多样性水平高(D=0.9638-0.9960,G/N=0.83-0.96),仙人洞和尼西两个居群检测到的克隆分株较多； 两个居群中都有一定的克隆生长,同一个克隆的分株距离邻近,两个居群共检测出九个克隆系,其余都为基因型不同的个体. 黄花杓兰的种子极小,种子繁殖投入的资源成本相当巨大,通过幼苗补充来重建居群很困难.本研究结果表明,黄花杓兰的遗传多样性水平较高,居群间遗传分化不大,克隆繁殖能力有限.因此推测黄花杓兰资源遭受严重破坏的主要原因是人类干扰,如公路修建,旅游开发,放牧压力,过度采挖等,对黄花杓兰的生态环境造成很大的破坏,居群数量急剧下降.因此,原生地生态保护及进行人工繁育是较为合适的保护策略.