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对于当今在普通船舶动态特性分析中常用的两种方法：迁移矩阵法和有限元法，能否适用于双体船这种船体结构较为复杂的问题，本文以一艘双体船为对象，分别采用这两种方法对其进行了动态特性分析，对比它们在建模过程中对结构刚度、质量的不同处理，以及计算所得自然频率结果的差异，提出了在双体船动态特性分析中迁移矩阵法的结果偏大及其原因，并指出在双体船的不同设计阶段，应当针对不同的精度要求，综合考虑费用与时间因素，合理的选用这两种方法。 由于有限元计算结果中，存在大量的局部振动，局部振动与整体振动的耦合及扭转振动与弯曲振动的耦合，很难有效的识别全船模态振型。本文采用三种辅助手段消除大量局部振动，减少局部振动对整体振型判读的影响，效果比较明显。