基于PacBio SMRT测序技术评估妊娠期糖尿病人的肠道菌群

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在人体肠道内有一个相对稳定的微生物菌群,即肠道菌群,其组成与人类多种疾病的发生相关。目前已有研究报道,妊娠期糖尿病(Gestational diabetes mellitus,GDM)的发生与肠道菌群的动态变化密切相关。本研究首次使用PacBio SMRT测序技术中的16S rRNA扩增子测序的方法,对97位孕妇的肠道菌群进行了测序。并根据民族差异(汉族和蒙族)和是否患有GDM将所有样品分为了四个组,最后对这四组样本的肠道菌群进行了评估及比较分析。总体来说,本研究发现处于相同孕期的孕妇肠道菌群的组成十分相似,本文对核心菌群的结构进行了详细的分析,发现四个分组间共有398个OTUs,占所有OTU数目的69.3%。并且本研究也对种水平上的不同分组间的核心微生物进行了相关性分析,发现不同的核心菌群展现出不同强弱的相关性。这一结果说明这些核心微生物之间的相互关系十分复杂,这种复杂的关系网络可能对肠道菌群的动态变化起着重要的作用。另外,本研究在种的水平上共鉴定到了44个种,并且利用统计分析软件在不同分组间找到了一些细微差异。本研究发现在汉族人中,患有妊娠期糖尿病的孕妇肠道菌群中Akkermansia muciniphila菌的相对丰度要显著低于健康孕妇;而在蒙族人中,健康孕妇与GDM孕妇间差异并不明显。在健康对照中发现汉族孕妇肠道菌群中Bacteroides uniformis菌的相对丰度显著高于蒙族孕妇;但在患有GDM组中未找到不同民族分组间的差异。功能预测结果发现四组样本菌群功能组成高度相似,大多数功能基因都与能量代谢有关。汉族GDM患者与健康对照组间没有发现显著差异,但在蒙族GDM患者中发现无机离子运输与代谢([P]Inorganic ion transport and metabolism)等功能相对丰度显著高于与蒙族正常孕妇。因此,本研究推论,在相同的孕期内,妊娠期孕妇的核心肠道菌群结构与功能是处于相对稳定的状态的,而民族差异也不会对妊娠期菌群变化产生显著性影响。但在四个分组间可以检测到一些低丰度的差异菌群,如Akkermansia muciniphila,其丰度的变化可能导致了肠道中一些与肠道营养吸收等有关的代谢发生一些变化,而这些变化可能与妊娠期糖尿病的发生密切相关。本研究得到的研究结果及研究思路将为进一步的探究肠道菌群在GDM发病机制中的作用提供参考。
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