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本研究以遗传差异较大的两个中国甜瓜地方品种的自交系4G21(属于东亚薄皮甜瓜次级起源中心)和3A832(属于西亚厚皮甜瓜次级起源中心)为作图亲本,以杂交组合4G21/3A832 F2分离群体的114个单株为作图群体,利用SRAP(相关序列扩增多态性)标记技术构建甜瓜分子遗传图谱。甜瓜作图亲本的多态性研究表明:在184个SRAP引物组合中有176个扩增出多态性条带,不同引物组合扩增的多态性条带的变异幅度在1~15之间,共扩增出614个,平均每个引物组合扩增出3.34个,说明SRAP标记对甜瓜作图亲本多态性分析具有较高的效率。在作图亲本上29对引物组合共扩增出187个多态性标记位点;每个引物组合扩增的多态性标记位点数量的变异幅度在1~15之间;平均每对引物组合产生6.45个多态性标记位点;在187个标记位点中,96个来自于母本,占总数的48.7%,91个来自于父本,占总数的51.3%,多态性位点在两个作图亲本上的分布比例接近1:1,说明多态性位点在两个作图亲本上的分布相对比较均衡。对187个SRAP标记位点进行连锁遗传分析,构建了由152个位点组成12个连锁群的甜瓜分子遗传图谱,该图谱长2077.1cM,覆盖基因长度约63.9~91.2%,平均图距13.67cM。每个连锁群的标记数在6~32个之间,平均图距在9.72~19.19cM之间,连锁群长度在85.3~469.1cM范围内。连锁群上有7个(4.6%)分子标记位点出现偏分离,并在统计上达到显著或极显著水平。该图谱是国内构建的第一张甜瓜分子遗传图谱,将为重要园艺性状基因定位、分子标记辅助育种、图位克隆和比较基因组学等研究提供重要的基础资料。