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近年来，来源于海洋微生物的天然产物因其新颖的结构和良好的活性受到了科学家们的广泛关注。海洋真菌是海洋微生物的重要组成部分，以种类较多和活性代谢产物丰富而著称，已成为寻找新药先导化合物的重要源泉。本论文以3株海绵来源的真菌和3株深海沉积物来源的真菌作为研究对象，从活性菌株的分离筛选开始，一直到单体化合物生物活性的初步评价为止都做了系统的叙述。 从广东湛江徐闻采集到的海绵中分离到60株真菌，采用TLC及HPLC化学筛选模型结合卤虫致死活性筛选模型，得到3株活性真菌Aspergillus sp.SCSIOXWS02F40, Dihymellaceae sp.SCSIOXWS02F46, Alternaria sp.SCSIOXWS02F49，和从深海来源的3株真菌Aspergillus sp.SCSIOInd09F01，Ascomycota sp.SCSIO Ind19F07，Penicillium sp.F00120共计6株真菌做为本论文的研究对象。 从菌株SCSIOXWS02F40分离得到20个化合物(1-20);从菌株Dihymellaceaesp.SCSIOXWS02F46大米发酵物中分离得到17个化合物(21-37);从菌株Alternaria sp.SCSIOXWS02F49大米发酵物中分离得到25个化合物(38-62);从菌株Aspergillus sp.SCSIOInd09F01大米发酵物中分离得到22个化合物(63-84);从菌株Ascomycota sp.SCSIOInd19F07大米发酵物中分离得到8个化合物(85-92);从菌株Penicillium sp.F00120高盐大米发酵物中分离得到9个化合物(93-101)，共101个化合物。采用质谱、核磁共振谱、圆二色谱、X-ray单晶衍射、红外光谱和紫外光谱等多种波谱方法，结合文献确定了全部101个化合物的平面结构，包含23个新化合物(1-10，21-27，38-40，63，64，85)，和2个新天然产物(32，37)。新化合物的类型有:聚酮类化合物10个，其中包含2个结构新颖的含有巴豆酸甲酯的asteltoxin吡喃酮类化合物(1，2)，2个罕见的苯并螺环聚酮类化合物(26，27)，4个色原酮类化合物(3，10，21，63)和2个其他类型的聚酮(9，85);生物碱类化合物9个，其中包含5个D型苯丙氨酸二酮哌嗪类化合物(4-8)，3个自然界罕见的二联苯杂合苯并噻唑类化合物(38-40)和1个新颖的acremolin类似物(64);3个二苯醚类似物(23-25);1个苯酚衍生物(22)。采用NOESY，旋光，确定了化合物(1，2)的绝对构型;采用NOESY，计算CD的方法探讨了化合物(26，27)的绝对构型;采用NOESY，X-Ray单晶衍射，CD，Marfy水解的方法确定了化合物(4-7)的绝对构型。 在部分单体化合物的活性评价中发现:1个色原酮类化合物(19)，5个二苯醚类化合物(24，28，69，70，73)对不同的肿瘤细胞有选择性的抑制作用;2个二苯醚类化合物(72，73)对金黄色葡萄球菌有显著的抑制活性，其IC50值分别为5.7μM，11.5μM;4个二苯醚类化合物(23，69，70，73)和2个二联苯化合物(59，61)有显著的的抑制COX-2酶的活性，其IC50分别为3.3μM，12.6μM，7.1μM，10.6μM，9.5μM，7.3μM;值得一提的是含有巴豆酸甲酯的Asteltoxin类化合物1，2对流感病毒H3N2有显著的抑制活性，其IC50为6.21μM，8.85μM，而化合物asteltoxin(13)却无活性，这一结论暗示了巴豆酸甲酯可能为活性基团，同时化合物1还对流感病毒H1N1一定的抑制活性，其IC50为3.52μM;色原酮骨架的化合物74对不同的肿瘤细胞有一定的选择性抑制作用，对结核菌和TNF-α都有较强的抑制活性，其IC50为4.1μM，6.8μM，而与其非常类似的化合物67却无这些活性，由此推断:活性的产生可能与苯环被还原有关。 综上所述，本论文详细叙述了从海洋来源的6株真菌的发酵产物中分离得到101个化合物，包括23个新化合物和2个新天然产物，并得到了一些活性较好的化合物，这为后续的研究奠定了坚实的基础。