一直以来，我国都把高等院校教育信息化建设与发展作为教育工作的重点，伴随而来的教育信息孤岛的存在已经成为普遍的事实，就其产生原因及解决之道众说纷纭。本文试图从博弈论的经典案例——“囚徒困境”出发，深层次剖析“高校教育信息孤岛”的产生根源，并在此基础上给出解决“高校教育信息孤岛”问题的策略选择。本文首先通过对我国“高校教育信息孤岛”现象及影响的分析，说明“高校教育信息孤岛”问题的普遍性和严峻性。接着，本文用博弈模型解析了“高校教育信息孤岛”的形成机理，由此得出个体的理性导致整体的非理性唯一均衡解(不共享，不共享)现象，而无法得出整体所需要的最优解(共享，共享)；另外，由于没有统一的信息标准，使得各信息系统平台不一致，代码不统一，数据格式不一致，使得各信息应用系统之间数据无法共享，信息无法沟通，这正是“高校教育信息孤岛”产生的根源所在。然后，为应对“高校教育信息孤岛”，提出建立新型的利益协调机制。最后，文章从调整博弈规则、博弈规范、博弈环境等方面出发提出解决高校教育信息孤岛问题之策略。