牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)、牛副流感病毒3型(BPIV3)和牛呼吸道合胞体病毒(BRSV)是引起奶牛病毒性呼吸道疾病的主要病原,牛感染后会影响奶牛的产奶量、公牛的繁殖力、育肥牛的增重以及牛的免疫功能,易继发细菌或支原体感染,从而导致奶牛严重的支气管炎和肺炎,给养牛业造成严重的经济损失。为调查新疆部分地区奶牛场3种病毒的感染情况,本研究从新疆石河子、奎屯、库尔勒、沙湾、阿克苏地区的五个规模化奶牛场采集1月龄以内犊牛鼻拭子226份,其中发病犊牛180份,相同日龄健康犊牛46份,通过采用抗原双抗体夹心ELISA、PCR和RT-PCR的方法检测3种病毒的感染情况,并对检测的病毒进行核苷酸序列分析与基因分型。研究结果如下:1.ELISA方法检测IBRV的平均感染率为17.96%,不同地区感染率为10.20%-29.17%;PCR方法检测IBRV的平均感染率为55.83%,奎屯、石河子、沙湾、库尔勒、阿克苏地区的五个奶牛场的感染率分别为44.90%、46.67%,48.33%,66.67%和72.22%;表明在检测的新疆部分地区IBRV的感染较为普遍;实验毒株与美国和巴西参考株由共同祖先进化而来。2.ELISA方法检测BPIV3的平均感染率为2.43%;PCR方法检测BPIV3的平均感染率为35.44%,奎屯、石河子、沙湾、阿克苏、库尔勒地区的五个奶牛场的感染率分别为24.49%、28.00%、31.67%、44.44%和45.83%;表明在被检测的新疆部分地区BPIV3的感染较为普遍。对其中8株阳性样品进行g M基因序列分析,比较其同源性为97.90%,同BPIV3a亚型参考毒株的同源性为93.0%-95.7%,与澳大利亚BP13JCU和美国Kansas毒株由共同祖先进化而来,将其划分为BPIV3a亚型。3.PCR方法检测IBRV,发病犊牛与健康犊牛的平均感染率分别为为56.67%和28.26%;RT-PCR方法检测BPIV3,发病犊牛与健康犊牛的平均感染率分别为为36.11%和13.04%。表明两种病毒在检测的新疆部分地区的犊牛呼吸道疾病中发挥致病作用,且IBRV和BPIV3均存在隐性感染。4.在检测的新疆部分地区,存在IBRV和BPIV3的混合感染,整体混合感染率为9.73%。5.抗原双抗体夹心ELISA方法和RT-PCR方法均未检测到BRSV阳性样品。表明本次所检测的新疆部分地区奶牛场的犊牛样品中不存在BRSV。本研究初步调查了新疆部分地区IBRV、BPIV3和BRSV的感染情况,丰富了流行病学资料,并为3种病毒在新疆地区的免疫预防和疫苗研发提供了初步的理论依据。