α-葡萄糖苷酶抑制剂——阿卡波糖是治疗II型糖尿病的一种有效的药物，长期服用阿卡波糖，餐后血糖得到有效控制，而且对糖尿病人的血脂代谢，血压的控制以及对胃肠道功能的改善等方面具有明显的作用。因阿卡波糖的化学结构比较复杂，目前阿卡波糖工业规模的生产都是通过微生物发酵实现的。 本论文首先建立了阿卡波糖产生菌菌种选育的初筛方法，通过验证比色法与HPLC法检测结果的相关性，确定了琼脂块固体发酵与比色法相结合的筛选方法为有效的初筛方法，提高了菌种选育的效率。 其次，考察了紫外线诱变与NTG诱变的最适剂量，紫外线诱变90s， NTG处理60min，作用浓度2.5 mg/IIlL时诱变效果最好。为了实现理性化筛选，本论文考察了耐受麦芽糖和耐受甲胺的最适剂量，建立麦芽糖耐受筛选模型和甲胺耐受筛选模型。本论文还考察了原生质体制备的最适条件和原生质体再生的最佳条件。 在实现了原生质体制备和再生的基础上，本论文对阿卡波糖产生菌进行了原生质体融合与基因组重排。以一株麦芽糖耐受菌株，一株利福平抗性菌株作为出发株，进行基因组重排，考察了原生质体融合的条件，考察了原生质体双亲灭活及融合的条件，经过基因组重排，得到融合子2＃，阿卡波糖的发酵单位达到了3714μg/mL，再经过发酵条件的优化，最终目的菌株的产量达到3965.1μg/mL，比出发菌株效价提高了78.4％。