十八大以来中国一直把创新驱动发展摆在核心战略地位,在创新发展方面取得了卓越的成就和进步,但也面临着一些瓶颈问题,如地区之间发展不平衡,区域之间差距进一步扩大,创新效率不高,创新质量未得到重视等。所以本文从缩小地区差异和提高创新效率方面进行了探索性的研究。本文以30个省为研究对象,从人才、资金和技术三个方面建立了创新要素投入指标体系,并采用区位熵和熵权法结合的方法分别测度区域创新要素的集聚水平,从而对其要素集聚水平的区域分布差异和集聚水平的变化趋势分别进行阐述。同时,本文以DEA(数据包络分析法)方法中的CCR模型为基本思想借助Matlab软件测算样本区域创新效率,分析其总体变化趋势。接着建立了区域创新要素集聚水平与创新效率之间的回归模型,利用固定效应模型从全国和分地区角度分别分析检验创新要素区域集聚对区域创新效率的影响。得出如下结论:人才要素和资金要素集聚分布表现为东部地区高于中部地区高于西部地区,而技术要素集聚分布总体表现为中西部略高于东部地区的态势。创新效率从2005年开始表现出一种稳定的上升趋势,我国创新效率较11年前有了很大的提升。回归系数显示影响创新效率的主要因素是人才集聚和资金集聚,而且人才集聚的影响大于资金集聚的影响,技术集聚对效率的影响较小。从控制变量来看,教育水平、经济发展水平和产业结构均对效率产生了正向影响,其中教育水平的影响最大,产业结构次之,经济发展水平最小。分地区来看,人才要素集聚水平在东部呈负相关而在中西部地区呈正相关,表明人才要素在东部地区存在冗余而中西部地区则不足。资金要素在东部地区表现为正向影响而中西部表现为负向影响,表明资金要素在中西部地区尚未形成集聚效应,而在东部地区形成了集聚效应,集聚水平的进一步提高可以促进效率提升。对于技术要素而言,不论是分地区还是全国总体来看都是负向影响,一方面可能是因为集聚水平尚未达到集聚效应发挥的临界值,另一方面可能是其投入和人才、资金的投入不匹配,投入结构不合理导致的。基于研究结论,本文提出要鼓励创新人才在区域之间的流动,促进区域之间的知识共享和技术共享,加快促成跨地区研发项目的落成,支持建立跨地区人才交流中心的建设,充分发挥政府作为创新主体的协调和控制作用。