蓝藻TonB-ExbB-ExbD依赖的外膜铁吸收机制研究

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尽管铁元素在地壳中的含量很丰富,但是环境中生物可利用铁量非常低。在自然水体环境中,铁易形成Fe(OH)3沉淀,导致水体中溶解态的铁浓度很低。在一些海洋和淡水环境中,可利用铁是初级生产力的主要限制因子。蓝藻是全球初级生产力的主要贡献者,能够吸收大量的CO2,对缓解温室效应有重要的意义。光合生物需要需要大量的铁元素参与光合电子传递,但是蓝藻却广泛分布于许多缺铁的水体环境。  然而蓝藻的低铁适应机制,目前还需要深入研究。本研究主要以模式蓝藻集胞藻PCC6803为材料,利用生理、生化和分子生物学手段等研究了蓝藻外膜铁转运的分子机制。取得了以下主要研究结果:  1.集胞藻PCC6803铁吸收相关基因的筛选与鉴定。将得到的24个突变株在铁限制条件下培养,除了已知的铁吸收相关基因之外,还发现7有个突变株的生长受到了显著的抑制。其中发现和大肠杆菌中二价铁离子输出蛋白高度同源的Sll1263蛋白在蓝藻的铁吸收过程中有重要作用。在铁充足条件下,基因失活以后铁吸收相关基因上调表达,缺铁后基因上调幅度加大。铁限制条件下,与野生型相比sH1263::C.K2的生理表型受到显著的抑制。在铁充足条件下,sll1263::C.K2突变株胞内的铁含量下降。Sll1263蛋白参与蓝藻的铁吸收过程,而其他大部分已知的CDF家族蛋白参与金属离子外排的过程。为我们理解蓝藻特殊的铁吸收机制提供了理论基础。  2.ExbB-ExbD的鉴定与功能研究。在对突变株的表型测定中,发现ton、exbB-exbD的同源基因失活后,铁限制条件下突变株的生长受到显著抑制,TonB-ExbB-ExbD蛋白在蓝藻铁吸收过程中的作用引起了我们的关注。通过生物信息学,发现非嗜铁素分泌型集胞藻PCC6803的基因组中存在三个可能的exbB-exbD基因簇。这三个基因簇的功能是相似的,敲除失活其中一个基因簇,单突变株的生长速率下降、细胞色素含量降低、细胞铁含量降低、铁吸收速率下降;失活其中两个基因簇,双突变株受到的铁限制更为显著;将这三个基因簇同时失活,藻细胞死亡。酵母双杂交实验表明ExbB和ExbD有蛋白-蛋白相互作用,大肠杆菌的同源基因可以替代这三个基因簇在铁吸收过程中的功能。通过55Fe短时吸收实验发现,ExbB-ExbD蛋白复合体参与了蓝藻对无机自由铁和有机螯合态铁(ferrioxamine B)的吸收过程,蓝藻对无机自由铁的吸收速率大概是有机螯合铁的800倍。  3.TonB蛋白的鉴定和功能研究。ExbB-ExbD与TonB蛋白形成复合体起作用,本研究根据已发现的ExbB-ExbD蛋白复合体,鉴定了集胞藻PCC6803中的两个TonB蛋白,Slr1484和Sll0188。这两个蛋白有TonBs蛋白家族保守的CTD二级结构和三级结构。将这两个蛋白分别失活后,在铁限制条件下突变株的生理表型受到抑制。Slr1484和Sll0188和已鉴定的ExbD蛋白有蛋白质相互作用,E.coli-TonB可以分别互补这两个突变株的铁限制表型,表明Slr1484和Sll0188是synTonBs蛋白。  4.TonB依赖的外膜受体蛋白的鉴定与功能研究。通过与已鉴定的TonB之间的蛋白相互作用分析,发现两类TonB依赖的外膜受体蛋白。其中一类和大肠杆菌中的嗜铁素-铁的外膜受体蛋白具有同源性,它们分别是Sll1206、Sll1406、Sll1409和Slr1490。在铁限制条件下,这些基因的突变株表型和野生型没有显著性的差异。第二类蛋白是一类具有独特性的beta-桶状蛋白,它们分别是Sll1271、Sll0072、Slr1908、Sll1550、Slr1841和Slr0042。这类蛋白在所有蓝藻中高度保守,但在其它物种中没有同源蛋白,它们在三级结构上和革兰氏阴性菌的外膜孔蛋白具有一定相似性,但是氨基酸序列同源性极低。将其中的一个基因失活,导致突变株在铁限制条件下突变株的生长受到了显著的抑制,而其中Slr1841和Slr1908始终不能获得敲除完全的突变株。  本研究在蓝藻中首次鉴定了ExbB-ExbD、synTonBs(Sll0188和Slr1484)和两类TonB依赖的外膜受体蛋白,并发现TonB-ExbB-ExbD依赖的转运系统对蓝藻自由铁的吸收有至关重要的作用。其中一类通道蛋白为蓝藻所特有并且参与蓝藻的铁吸收过程。
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