论文部分内容阅读
猪细小病毒病是由猪细小病毒引起的以母猪，特别是初产母猪产出死胎、畸形胎、木乃伊胎以及病弱仔猪为特征的繁殖障碍性疫病。该病广泛存在于世界各国，严重影响养猪业发展。 本研究以仔猪原代肾细胞培养PPV SR-1株病毒并提取病毒的模板DNA，参考GenBank上猪细小病毒基因组序列，设计合成4对引物，通过PCR反应扩增了PPV SR-1株的全部编码基因以及5’末端序列。利用DNAMAN软件将全部序列进行拼接，组成PPV SR-1株近全基因序列。序列分析结果显示：SR-1株的序列长4877bp，与PPV的Kresse株、NADL-2(5075)株、NADL-2(5034)株和NADL-2(4973)株的核苷酸同源性分别为：93.18％、95.67％、95.51％和95.33％。基因结构分析表明，PPV SR-1株的基因组由2个开放阅读框组成，3’端编码结构蛋白，5’端编码非结构蛋白，整个编码区相互重叠，VP2位于VP1内，NS1包含NS2，NS3则跨越NS1和VP1。NS基因位于左阅读框中，NS1基因从ATG开始到TAA结束，共1989个碱基，编码662个氨基酸；NS2基因从NS1基因相同的起始位点开始编码，编码了86个氨基酸后，便含有了一个长达1472个核苷酸的内含子，之后又与NS1错位编码剩余的75个氨基酸，共编码161个氨基酸；NS3基因也是从NS1基因相同的起始位点开始编码，编码了86个氨基酸后，有一个长达1859个核苷酸的内含子，之后与VP1基因重叠错位编码剩余的21个氨基酸。VP基因位于右阅读框中，VP1从ATG到TAG共含有2263个碱基，中间含有一个73碱基的内含子，共编码730个氨基酸；VP2则从VP1中间开始编码，与VP1共同中止于同一个TAG处，全长1740bp，编码580个氨基酸。 PPV SR-1株和其它细小病毒的进化树分析表明，PPV SR-1株与PPV中国毒株以及NADL-2(5075)的遗传距离最近，其次是Kresse毒株。就种间进化而言，PPV与FPV、MEV、CPV和MVM有共同的进化来源，而与ADV、B19、BPV和GPV遗传距离较远。