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本论文内容安排如下:第一章中，将着重介绍DNA和RNA的基本结构特征和热力学、动力学基础以及Metadynamics和它的变种采样方法;第二章中，将介绍利用简化模型对Metadynamics及其变种采样方法的准确性进行测定的工作;在第三章中，会介绍采用Bias exchange Metadynamics以及常规分子动力学模拟对DNA G-quadruplex结构折叠机制研究的工作;第四章中，将介绍采用Biasexchange Metadynamics研究RNA赝结结构折叠机制的工作;最后，在第五章中，将对本论文进行总结，并对未来的工作进行展望。