新型农村合作医疗是减轻农民医疗经济负担、改善农民医疗服务、缓解农民因病致贫、因病返贫的问题的重要制度建设。但在其运行中也出现了一些问题，如运行成本相对较高、制度建设滞后于社会需求、制度环境尚待优化、农民参保的信心较为缺乏等。本文以广州市番禺区新型农村合作医疗为个案，研究新型农村合作医疗的制度建设，为我国新型农村合作医疗运行机制的完善提供经验借鉴。　　 本文以广州市番禺区新型农村合作医疗为研究对象，对番禺区新型农村合作医疗的运行情况进行了全面的研究。文章分析了番禺区新型农村合作医疗筹资机制、基金运营管理机制、补偿机制和监管机制等的制度设计，指出其在参合人数和参合率、参合农民的偿付规模和水平以及农村医疗机构建设等方面都取得了较大的成就。但是番禺区的新型农村合作医疗也出现了医疗费用的快速上涨、基金结余不足、人员编制缺乏、商业运作模式尚待规范等问题，文章从法律因素、农民参合意识因素、政策因素和外部环境因素等方面，就问题的原因进行了剖析，并提出了完善番禺区新型农村合作医疗的建议。最后，根据番禺区新型农村合作医疗的启示，提出我国应该从完善以基本医疗需求为导向的具体制度安排、建立财政主导的稳定筹资机制、引入市场机制提高基金运行效率、建立公平合理的补偿机制、实行多元化的监督制度和构筑医疗救助等“第二保障”体系的角度，提出完善和发展我国新型农村合作医疗的对策。