龙须菜琼胶合成相关基因的克隆及其表达调控的研究

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nice_hope
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
龙须菜(Gracilaria/Gracilariopsis lemaneiformis)是一种大型海洋红藻。隶属于红藻门(Rhodophyta)、红藻纲(Rhodophyceae)、杉藻目(Gigartinales)、江蓠科(Gracilariaceae)。龙须菜最重要的经济意义在于其产生琼胶。琼胶是藻类的一种特殊碳储存物质。作为主要的经济型产琼胶海藻,开展龙须菜琼胶合成相关基因的研究,具有重要的理论意义和经济价值。UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(UGPase)基因glugp是红藻琼胶代谢过程中的一个重要酶。我们采用RT-PCR方法获得glugp cDNA的部分序列,RACE方法获得其cDNA的3’端和5’端序列,本文从基因组DNA和cDNA的水平分析了该基因的特征。glugp cDNA序列全长为2200 bp,其中包含一个1485 bp-可翻译成494个氨基酸残基的完整开放阅读框(ORF)。该基因的氨基酸序列与其它物种的UGPase氨基酸序列相似性较高。rpsBLAST分析表明在105至400个氨基酸之间存在酶活性位点和底物结合位点,其中包含5个保守的赖氨酸残基。获得的5’UTR部分包含330个碱基,5’侧翼序列的翻译初始位点序列为GCTATG,与多数红藻的RCYATG的翻译起始特征一致。3’UTR部分包含385个碱基,在终止密码子UAG之后261个碱基处存在一个3’末端多聚A前的加尾信号:ATTATT。对glugp基因序列分析发现,该基因不含有内含子,它的DNA与cDNA序列一致。通过Southern杂交结果显示该基因是单拷贝的。本实验研究了不同琼胶含量的藻株中glugp基因的表达情况。将同株的龙须菜从基部分为2份分别培养在正常和低盐诱导条件下,2周后分别提取样品琼胶和RNA。将RNA反转录为cDNA,然后利用荧光实时定量PCR的方法检测基因的表达水平,采用2-ΔΔCT法分析基因的相对表达量。结果表明这两组样品的琼胶含量差异不显著,且glugp基因的表达量间也不存在显著差异。同一海区中,龙须菜不同藻株的琼胶含量存在差异。选取了2组琼胶含量差异显著的野生藻株,分别提取每组中藻株样品的RNA并反转录为cDNA,利用荧光实时定量PCR的方法对glugp基因的表达情况进行分析。结果表明,glugp基因的表达与琼胶含量存在显著相关性,该基因在高琼胶组藻株中的表达量显著高于低琼胶组藻株。说明glugp是琼胶合成途径中的一种重要酶。glugp基因的表达量对琼胶含量高低具有指示作用,有作为龙须菜琼胶含量的指标而应用于产业化的潜能。对龙须菜不同培养条件和环境因子影响下的琼胶含量及生化性状进行了研究,从而筛选出诱导琼胶高产的培养条件,为筛选琼胶合成相关基因奠定基础。对野生型龙须菜的雌配子体和四分孢子体的琼胶含量进行测定。结果表明,雌配子体的琼胶含量高于四分孢子体的琼胶含量。曾有研究报道过,江蓠属和石花菜属的产琼胶红藻在低盐度、氮限制和磷限制的培养条件下,琼胶含量增加。实验设置了低盐、氮限制、磷限制和正常这四种培养条件,提取各培养条件下藻体的琼胶并对各培养条件下藻体的藻红素含量和叶绿素a含量进行测定和分析,从而确定野生型龙须菜在这些不同培养条件下的琼胶含量变化和生化性状。实验结果表明,培养一周后,各条件下藻体琼胶含量差异不大,磷限制条件下藻体琼胶含量较低。培养3周后,低盐诱导对龙须菜琼胶含量的影响显著,低盐培养的藻体琼胶含量高于正常培养条件,且低盐培养时藻体藻红素含量正常。氮限制培养条件下藻体琼胶平均含量较高,但与正常对照之间的差异不显著,藻红蛋白和叶绿素a的含量均较低。磷限制条件对藻体琼胶含量的影响并不明显,且藻红蛋白和叶绿素a的含量与对照组相似。这些结果表明,低盐培养条件可诱导龙须菜琼胶含量增加,低盐诱导条件下差异表达的基因可能包含有琼胶合成过程的重要基因。这为构建抑制消减文库,筛选与琼胶合成相关的基因奠定了基础。
其他文献
补偿生长是鱼类营养生理学研究的热点之一,对这一领域的研究有助于了解鱼类在补偿生长过程中的特点、规律和生理机制,为鱼类生长研究提供理论依据,对提高养殖鱼类的饲料效率
本研究利用已构建的斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)头肾Smart cDNA文库,首次克隆表达了斜带石斑鱼C-反应蛋白(EC-CRP)基因,并纯化获得了EC-CRP基因表达蛋白。EC-CRP的cDNA
校长治校方略rn近年来,我们充分利用学校、社区和地方的课程资源,拓展综合实践活动实施的空间,开发具有本校特色的综合实践活动课程,收到了良好成效.rn1.构建主体框架.①构建
草鱼(Ctenopharyngodon idellus)是我国重要的淡水养殖鱼类,为初步分析草鱼2代选育进展,本研究通过养殖桶养殖与同池混养相结合的方式对草鱼F1代与F2代群体的生长性状进行了
综合实践活动课程的开发与实施,是新课程改革的重要方面.作为省综合实践活动实验区,我们在这方面做了大量工作.为全面推进综合实践活动课程扎实有效地开展实施,我们不断更新
斑鳢(Channa maculata)和乌鳢(Channa argus),同属鲈形目(Perciformes)、鳢科(Channidae)、鳢属(Channa),是重要的淡水经济鱼类。具有肉鲜味美,营养丰富,无肌间刺,易养殖,生长速度
学位
本研究结合卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)的窒息点及低氧胁迫下的存活量变化,分析了卵形鲳鲹的低氧耐受性,运用光学和电子显微技术,研究不同形式(急性和慢性)的低氧胁迫对卵
主题发言评价,是运用标准对事物的准确性、实效性、经济性以及满意度等方面进行评估的过程。语文教学评价也是如此。新课程改革以来,语文教学评价有了质的飞跃,一些新的教育
语文课程的基本特点是工具性与人文性的统一语文课程的基本特点是工具性与人文性的统一,语文课程应致力于学生语文素养的形成与发展形成与发展。赵景瑞老师执教的《这句话的
翻杂志,看到一位教师的试卷调研中有这样一道题:rn先观察,再在括号里说明.rn(224/4 56←商的小数点要和被除数的小数点对齐.20/24←这里的24表示24个()24/0)rn这道简单的填空