论文部分内容阅读
本研究针对双肌臀(Callipyge)基因的SNPs开展研究,通过多种分子遗传标记方法探讨它们对肉羊后臀发育的影响,进而为肉羊的合理选育及肉羊新品种的培育奠定基础。本试验选择无角陶赛特、萨福克成年公羊为试验材料,经颈静脉采血提取血液中基因组DNA,并现场对采样肉羊进行臀围和臀宽测量。1:实验一选择SNPCLPG两侧的五个微卫星点(OY3、MCMA26、UWCA4、TGLA122、BM3413)。对五个微卫星点的遗传变异(基因频率、杂合度、PIC和有效等位基因数)进行了初步分析和研究。结果显示这5个微卫星点在萨福克、无角陶赛特2个群体中都存在多态性,等位基因数均大于8,然后通过对5个微卫星不同基因型与无角陶赛特和萨福克臀围臀宽指标进行相关性分析,结果发现微卫星OY3、MCMA26、UWCA4不同基因型对萨福克羊的后臀发育有显著影响(P<0.05),微卫星OY3、MCMA26、UWCA4、TGLA122、BM3413不同基因型对无角陶赛特羊的后臀发育有显著影响(P<0.05);同时也发现了一些与无角陶赛特和萨福克后臀发育紧密相关的等位基因。研究结果初步说明所选择的微卫星标记座位与肉羊后臀发育间存在连锁关系,在生产实践中,这些标记有可能成为标记辅助选择和早期育种的分子标记。2:实验二采用PCR-SSCP技术分析肉羊双肌臀(CLPG)基因SNPs在无角陶赛特和萨福克羊中的单核苷酸多态性,研究SNP对肉羊后臀发育的影响。结果表明:CLPG基因的SNP在无角陶赛特和萨福克羊中存在多态性,在两个品种中都发现了AA、AB和BB三种基因型。测序发现,BB与AA型相比在扩增片断的第118位存在G-A的碱基突变,在无角陶赛特群体中基因型频率分别是AA(0.7391)、AB(0.2174)、BB(0.0435);在萨福克群体中基因型频率分别是AA(0.6667),AB(0.2667)、BB(0.0666)。经相关性分析,由无角陶赛特肉羊中各基因型臀围和臀宽的最小二乘均值表明,AB基因型(分别是41.85和24.05)和AA基因型之间(37.54和24.05)差异显著((P<0.05),BB基因型(分别是43.92和25.22)和AA基因型之间(37.54和24.05)差异显著((P<0.05);由萨福克肉羊中各基因型臀围和臀宽最小二乘均值表明,AB基因型(分别是45.80和27.80)和AA基因型之间(40.70和24.05)差异显著((P<0.05),BB基因型(分别是46.02和28.33)和AA基因型之间(40.70和24.05)差异显著((P<0.05)。结果说明,该SNPs对肉羊后臀发育影响显著,可能是与CLPG紧密连锁的QTL。3:实验三利用PCR-RFLP技术分析肉羊CLPG)基因的SNPs在无角陶赛特和萨福克羊中的限制性片段长度多态性。结果表明:CLPG基因的SNP在无角陶赛特和萨福克羊中存在多态性,在两个品种中都发现了AA、AB和BB三种基因型。测序发现,与AA型相比,BB型在扩增片段的第62位存在C-T的碱基突变。在无角陶赛特群体中基因型频率分别是AA(0.7391),AB(0.2174),BB(0.0435);在萨福克群体中基因型频率分别是AA(0.6000),AB(0.3333),BB(0.0667)。统计分析发现,该SNPs不同基因型臀围臀宽最小二乘均值表现为BB >AB>AA。结果初步揭示B等位基因可能与后臀的发育呈正相关。