基于转录组学检测的胆红素神经细胞毒性分子机制研究

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目的:利用大鼠原代神经细胞培养系统,采用转录组测序技术,观察非结合胆红素引起的神经细胞基因差异表达,揭示关键生物学过程或信号通路在胆红素脑病发病中的机理,丰富胆红素神经毒性机理,为探讨胆红素脑病防治的新靶点和干预措施提供科学依据。方法:MTT检测胆红素处理组和对照组神经细胞活力。经胆红素处理后对原代培养皮质神经元进行转录组测序分析。结果:(1)MTT实验显示胆红素可降低神经细胞活力,随着胆红素浓度升高,神经细胞活力下降。(2)实验组与对照组差异表达基因共有140个,其中117个是上调基因,23个是下调基因。共有135个基因得到数据库注释。COG分类中,脂质运输和代谢所占比例最大,为14~34.15%。差异表达基因KEGG注释中,类固醇生物合成这一代谢通路差异表达基因数目最多。KEGG通路富集分析显示,类固醇生物合成这一通路涉及的差异表达基因富集水平最显著。胆固醇属于类固醇,这引起了研究胆固醇的兴趣,为了避免遗漏,经过仔细查找,又查找到其他参与胆固醇生物合成的差异表达基因。共有13个差异表达基因参与胆固醇生物合成,且这些基因都表达上调。结论:经过数据库注释和富集分析,显示13个参与胆固醇生物合成的基因表达上调,数量较多,且富集水平较显著。可将胆固醇合成作为探索胆红素神经细胞毒性机理的一个方向,在后续研究中对相关基因进行验证。
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