这篇论文收集了大量的资料，对美国国立卫生研究院和德国马普学会，从经费使用、人才培养、科研合作、人员互动等方面进行了研究；对荷兰瓦格宁根大学与研究中心，具体阐述了瓦格宁根大学与荷兰农科院合并的背景、过程及成效。通过对以上三个个案的研究，可以发现：美国国立卫生研究院在经费上给予了大学大力的支持。美国国立卫生研究院内部科研机构的经费只占其总经费的10％左右，其余经费基本都对外拨款给医学领域的其它科研机构和大学。同时还广泛的培养青年工作者，给他们提供经费与优越的科研条件；马普学会与大学关系的显著特点在于合作培训人才上。马普学会虽然由政府拨款，但享有高度的自治权。经费虽然不外流，但是由于德国有科研与教育相结合的传统，所以，马普学会在科研上，尤其是科研设备和仪器等的共享上，与大学都保持着紧密的联系，还和大学共同创办了国际马普研究院，共同培养博士；瓦格宁根大学，为了长远利益，选择了与荷兰农科院合并的道路。通过合并，双方具有更大的合力来争取科研项目，参与国际竞争，提升自身的国际地位。 在对以上三个个案研究的基础上，结合我国科学院系统的具体情况，本文提出了几点建议。