基于转录组测序的黄瓜涩味相关基因挖掘与功能分析

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随着人们生活水平的提高,人们对黄瓜品质的要求越来越高。目前对黄瓜风味品质的研究主要涉及芳香物质、糖及有机酸等,但对黄瓜涩味品质的研究极少见文献报道。黄瓜涩味物质具有一定的保健价值,如抗癌,抗过敏,肝保护和抗血栓形成等。但涩味又是影响黄瓜果实口感的重要因素之一,较强的涩味会使人产生不愉快的味觉体验。因此,解析黄瓜涩味形成机制对黄瓜口感品质改良、医疗保健价值挖掘具有重要意义。本研究利用RNA-Seq及qRT-PCR技术对黄瓜涩味相关基因进行了挖掘与分析,主要研究结果如下:(1)在果皮中共获得115个显著差异基因,果肉中共获得59个显著差异基因。这些差异基因的表达量随着果实发育逐渐上调或下调,与黄瓜果实涩味口感强度及果皮、果肉中总儿茶素含量的变化趋势一致或相反。结合基因功能注释、GO和KEGG分析,7个苯丙氨酸代谢途径相关基因和3个糖类物质调控运输相关基因被候选为涩味相关基因。(2)果皮、果肉转录本之间存在显著差异,果皮中任意对比组中差异基因的数量均远高于果肉中同一时期对比组中的数量,且果皮涩味相关候选基因的数量也显著高于果肉。果皮是黄瓜果实涩味相关基因的主要表达部位,使其成为黄瓜果实产生涩味的主要部位。(3)Csa2M277600.1(糖苷水解酶)、Csa3M002800.1(黄烷酮3-羟化酶)和Csa3M002810.1(查耳酮异构酶)在黄瓜果实涩味形成中具有正调控作用;Csa6M044530.1(细胞色素P450环氧化酶)具有负调控作用。
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