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本研究采用SSR分子标记技术对33份印度、巴西玉米材料与6份测验种的遗传潜势进行研究,初步分析这39份自交系的遗传多样性及其亲缘关系;并从中选择具有代表性的10份材料和6份测验种,采用NCII设计,组配了60个杂交组合,通过一年两点(贵阳、施秉)田间鉴定方法分析了16份亲本材料的一般配合力、60个组合特殊配合力、总配合力和对照杂种优势,研究结果如下:1、32对引物总共检测到147个等位基因,每对引物检测到的基因位点变化范围为3-8个,平均为4.59个。每个SSR标记位点的多态信息量(PIC)变化幅度为0.5464-0.8624,平均为0.7326,根据32对引物对39份玉米自交系材料扩增结果建立的数据库,利用NTSYS2.10e软件计算了这39份玉米自交系间的遗传相似系数(GS),结果得出相似系数幅度为0.1562-0.8437,平均值为0.5177。按照类平均聚类法(UPGMA)对这39份玉米自交系进行聚类分析,结果表明,39份自交系以阀值0.53可以划分为6类。2、联合方差分析结果显示,在地点内区组中,只有吐丝期一个性状达到了显著水平,说明了除了吐丝期外,在同一个地点内区组间其他的11个性状表现相对比较稳定。在地点间,散粉期,吐丝期,株高,穗位高,穗长,穗行数,单株产量七个性状达到了显著和极显著,其他五个性状在地点间没有达到显著,这说明了散粉期,吐丝期,株高,穗位高,穗长,穗行数,单株产量七个性状受气候环境的影响较大,其他五个性状收到环境条件的影响相对较小。而在品种间及品种与环境的互作间都达到了极显著的水平,表明了品种间受到环境气候条件的影响特别大,以及品种与环境互作效应比较明显。3、16份亲本自交系一般配合力效应值分析结果:单株产量母本一般配合力正效应值有:363、133、149、223、236、279;其效应值分别为:5.13、2.73,、1.02、1.18、2.98、2.42.;父本自交系正效应只有1862.其正效应值高达6.45;4、60份杂交组合特殊配合力效应值分析结果:单株产量特殊配合力(SCA)效应值变化范围为-16.65—18.08,正效应值的组合有34个,其中特殊配合力效应值最高的6个组合是:Mo17x149、1862x223、Mo17x279、Mo17x133、S37x230、W527x349效应值依次分别为18.08、11.30、9.96、9.10、8.95、8.11.。5、60份杂交组合总配合力效应值分析结果:单株产量总配合力排名前十位为:1862x223、Mo17x149、1862x363、1862x193、1862x236、S37x363、Mo17x279、W527x363、Mox133、1862x279;其中,单株产量前五个父本中1862占了四个,而父本1862是这几个亲本中一般配合力效应值最高的,其效应值达到了6.45。6、60份杂交组合单株产量对照杂种优势分析结果:以“贵农玉889”作为对照,对照优势值有20个是正值,说明有20个组合单株产量超过了对照种,占60个杂交组合数中的33.33%。其中增产组合前五位分别为:1862x223、Mo17x149、1862x363、1862x193、1862x236。