纤维素被认为是广泛存在的可再生资源，预计未来将取代液体燃料。木质纤维素水解的单糖是重要的原料，因为这些混合单糖可用于各种生产过程，包括生产乙醇燃料。然而，纤维素高聚合度结晶结构具有天然抗性，因此难以进行物理或化学降解。其中，木质纤维素中木质素和半纤维素的存在也限制了它的降解。木质纤维素的降解过程是多种酶协同的过程。近年，发现一种能促进纤维素酶活性的蛋白，称为增效蛋白，其中Expansin家族和Expansin like家族引起许多研究者的关注。Expansin首先在黄瓜下胚轴中发现，并具有松弛细胞壁的功能，自身却不能水解纤维素。Expansin是一类基因超家族，其编码约25KDa的蛋白质。近年来，在细菌和真菌中发现了大量的Expansin like蛋白。枯草芽孢杆菌是第一种发现含有Expansin like的微生物，这种增效蛋白与纤维素酶具有协同作用，能大大提高纤维素酶水解的效率。由于微生物是工业生产最理想的生物，所以，本研究目的是从细菌中发现含有潜在增效蛋白的新菌种。　　首先，以枯草芽孢杆菌Expansin like序列(gi|2619024|gb|AAB84448.1| YoaJ[Bacillus subtilis])为模版，初步找到大量的Expansin like同源序列，再根据这些同源序列找到这类蛋白高度保守的motifs，最后以motifs找到含有潜在增效蛋白的新菌种。运用同源建模的方法对新菌种氨基酸序列进行建模，与蛋白数据库中的Expansin like蛋白模型进行三级结构比对，确定含有相似的结构。经过整理分析获得Sterptomyces ipomoeae; Corallococcus coralloides; Saccharothrixsyringae; Cystobacter violaceus; Methylibium sp.CF059; Acidovorax radicis6种含有潜在增效蛋白的菌种。　　根据比对结果从普通微生物保藏中心购买甘薯链霉菌菌株，根据序列特异性设计引物。提取番薯链霉菌总基因组，进行PCR扩增，序列长672bp，凝胶回收扩增片段，提取pET-28a(+)和pET-32a(+)质粒与回收的目的片段进行双酶切，回收双酶切片段在T4连接酶的体系下连接，形成重组质粒，热激转化入E.coliDH5α，平板涂布后挑选单菌落，送去测序。分析测序结果确定正确重组质粒，提取质粒分别转化入感受态细胞E.coli BL21和E.coli Rosetta(DE3)，平板涂布挑选单菌落，测序获得重组表达菌。　　增效蛋白在大肠杆菌系统中正常条件表达时，出现了包涵体，在表达温度从28℃降低至16℃，转速由180rpm降至100rpm后，蛋白表达速率降低，包涵体的量大大减少，SDS-PAGE电泳中可溶的目的蛋白条带变得明显清晰。根据重组蛋白His标签的特性，运用梯度纯化的方法，进行Ni柱洗脱纯化，运用实验室滤纸酶解体系，测得Sip1-pET32a(+)和Sip1-pET28a(+)重组菌表达粗蛋白的增效活性分别是32.3％和35.3％。