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目的探讨HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多态性及甲基化与新疆哈族食管癌的相关性及其临床病理学意义。方法1.运用序列特异性引物聚合酶链反应技术(PCR-SSP)检测200例哈族食管癌和150例正常食管粘膜的HLA-DRB1*0901、1501和HLA-DQB1*0301、0602的基因分布,并经测序证实; 2.运用免疫组化S-P法检测66例哈族食管癌和28例食管癌旁正常组织HLA-DP,DQ,DR蛋白的表达;3.运用基质辅助激光解析电泳时间飞行质谱仪MALDI-TOF MS检测66例哈族食管癌,20例癌旁组织和25例正常食管粘膜HLA-DRB1和DQB1甲基化状态;数据处理采用SPSS13.0软件包进行统计学分析。结果1. HLA-DRB1和HLA-DQB1基因多态性检测结果:(1)200例哈族食管癌中HLA-DRB1*1501和HLA-DQB1*0301、0602等位基因分布频率分别是0.455,0.76和0.69,与150例正常食管粘膜上述等位基因分布频率(分别是0.232,0.52,0.554)之间差异具有统计学意义(OR=2.78,OR=2.93, OR=1.80 ;P均<0.05),其中在82例HPV感染相关哈族食管癌中与正常食管粘膜相比,差异更具有统计学意义(OR=3.18, OR=2.37,OR=1.92 ;P均<0.05);(2)124例中低分化食管癌HLA-DQB1*0602等位基因分布频率(0.742)高于76例高分化者(0.597)(P<0.05);2. HLA-DP,DQ,DR蛋白表达检测:66例哈族食管癌HLA-DP,DQ,DR蛋白表达率为36.4%,高于28例癌旁正常食管组织蛋白表达率的7.1%(P<0.05);3. HLA-DRB1和HLA-DQB1甲基化检测结果:(1)66例哈族食管癌HLA-DRB1甲基化水平(甲基化CpG位点数+平均甲基化率)低于20例癌旁正常组织和25例正常食管粘膜(P<0.05),但与患者年龄、性别、食管癌分化程度、HPV16E6感染、HLA-II蛋白表达及HLA-DRB1基因多态性无明显相关性(P>0.05);(2)34例哈族食管癌HLA-DQB1甲基化水平高于10例癌旁正常组织和16例正常食管粘膜(P<0.05),但与患者年龄、性别、食管癌分化程度、HPV16E6感染、HLA-II蛋白表达及HLA-DRB1基因多态性无明显相关性(P>0.05);(3)15例哈族高分化食管癌HLA-DQB1 CpG6-7、CpG16 -17两个位点平均甲基化率(47.6%和42.6%)明显高于19例中低分化食管癌(18.3%和17.4%)(P<0.05)。结论1. HLA-DRB1*1501和HLA-DQB1*0301、0602等位基因增加了新疆哈族食管癌尤其是HPV相关哈族食管癌的患病风险,可能是新疆哈族食管癌的遗传易感基因; 2. HLA-DRB1和HLA-DQB1甲基化与新疆哈族食管癌发生有关, HLA-DQB1 CpG6-7、CpG16-17甲基化状态的改变与新疆哈族食管癌分化程度有关。