西湖、西溪湿地以及和睦湿地是杭州市重要的城市湿地生态系统。本文以三地水域中的原生动物为研究对象,于2014年6月到2015年5月,对三地水域内原生动物的种类数、丰度及环境因子进行了周年采样调查。研究期间共发现原生动物114种,其中西湖有纤毛虫27种,肉足虫24种,鞭毛虫6种,西溪湿地有纤毛虫54种,肉足虫20种,鞭毛虫14种,和睦湿地有纤毛虫57种,肉足虫29种,鞭毛虫13种。西湖原生动物丰度年平均值为纤毛虫333.38ind/L,肉足虫375.19ind/L,鞭毛虫61.25ind/L;西溪湿地原生动物丰度年平均值为纤毛虫545.15ind/L,肉足虫159.21ind/L,鞭毛虫331.76ind/L;和睦湿地原生动物丰度年平均值为纤毛虫553.99ind/L,肉足虫251.11ind/L,鞭毛虫276.10ind/L。三地纤毛虫均为群落中种类最大贡献者,所占比例为西湖47.4%,西溪湿地61.4%,和睦湿地57.6%。三地共同优势种包括王氏似铃壳虫(Tintinnopsis wangi)、尾眼虫(Euglena caudatd)、梭眼虫(Euglena acus)。环境因子分析显示,三地水质均处于富营养化状态。西湖pH、DO、T、COD、TN的年平均值均大于西溪湿地,西湖pH、DO、NO3-N的年平均值均大于和睦湿地,西溪湿地NO3-N的年平均值大于和睦湿地。Cluster分析结果表明,在50%相似性水平上,将原生动物群落分为三组(A/B/C/D/E/F、 a/1/e/5、b/2/f/6/c/3/d/4), ANOSIM检验显示R=0.818,P<0.01。三地原生动物和环境之间也具有相关性,BIOENV分析显示原生动物群落的变动不只是受单一因子的控制,而是受环境因子的综合影响,其中西湖相关性最高的是TN、NH4-N,西溪湿地相关性最高的是DO、TN,和睦湿地相关性最高的是TN、NH4-N、 NO2-N、NO3-N。