保守的Paf1复合物是一个多功能的复合物。在酵母中由Paf1，Ctr9，Leo1，Cdc73和Rtf1组成，而人源Paf1复合物还包括Ski8。在转录延伸过程中，Paf1复合物与活性基因的启动子和编码区相联系。Cdc73和Rtf1对Paf1复合物与染色质之间的联系是必需的。此外，Paf1复合物与FACT, Spt4-Spt5和TFIIS之间的相互作用也能够调节Paf1复合物向染色质的募集过程。　　Paf1复合物除了在转录延伸过程中的功能，它还能够促进转录相关的组蛋白修饰，包括H2B的单泛素化和组蛋白H3的甲基化过程。Paf1复合物能够募集泛素结合酶-连接酶复合物Bre1/Rad6，而Bre1/Rad6能够催化H2B的单泛素化过程，H2B的单泛素化又是甲基转移酶Set1/COMPASS和Dot1分别介导H3K4和H3K79甲基化的先决条件。此外，各种研究发现Paf1复合物还参与到其他各种过程中，包括RNA3-末端形成的转录后事件，胚胎干细胞的维持，哺乳动物胚胎发育及疾病状态和癌症的发展的免疫反应。　　目前，Paf1复合物自身的装配过程及其行使功能的分子机制都是不清楚的。在本论文中，我们在体外实验中确定了Paf1与Leo1之间的相互作用，并确定了Paf1和Leo1中各自的最小结合片段。我们解析了人源Paf1复合物中Paf1/Leo1亚复合物的结构，其分辨率为2.5(A)。结构分析显示Paf1和Leo1亚基之间的反平行β-折叠片层是两者之间的主要相互作用，并介导形成了紧密结合的Paf1/Leo1异源二聚体。缺失突变及免疫共沉淀实验表明Leo1亚基通过Paf1结合Paf1复合物，Ctr9支架蛋白是Paf1复合物组装过程中的关键亚基。此外，我们证明了Paf1/Leo1异源二聚体对其在体外特异性识别组蛋白H3，组蛋白八聚体和核小体是必要的。我们的研究结果揭示了Paf1复合物的组装过程和Paf1复合物介导的组蛋白修饰中的底物识别过程。