柑橘CBF类似基因的克隆与分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qingqing20090756
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柑橘是亚热带水果,在栽培范围上受到低温的限制。周期性冻害往往导致柑橘果实产量降低、品质下降,甚至树体死亡,从而造成巨大的经济损失。因此,防治冻害就成为柑橘产业发展和提高其经济效益的一个重要问题。解决这一问题的主要方法途径是加强田间管理和选育抗寒新品种,而后者是根本途径。近年来,采用基因工程手段培育新品种已成为农作物育种的一种趋势。植物抗寒性属于复杂的数量性状,是多基因协同作用的结果。采用单一基因转化植物,虽能在一定程度上提高转基因植物对低温的抗性,但实际效果往往不理想。CBF是调控一系列植物冷驯化相关基因表达的一种转录因子,在低温诱导下迅速合成,与相应顺式作用元件CRT/DRE结合,促进基因的转录,进而合成糖类、脯氨酸和膜蛋白等物质,提高植物的抗寒性。基因转化试验证明,CBF基因在拟南芥和油菜等多种植物中超量表达,转基因植株对低温的耐性均显著增强。这一发现为利用基因工程手段提高植物耐寒性提供了一条新途径。本研究从抗冻性明显不同的枳壳、脐橙和柠檬中分离出CBF同源基因的AP2核心区段,初步确证了柑橘中同样存在CBF介导的冷驯化过程。进一步从枳壳这一抗寒性最强的柑橘种类中克隆出CBF基因的全长cDNA,并进行全面的生物信息学分析,为今后利用这些基因提高柑橘抗寒性奠定基础。主要的试验结果如下:1.探索柑橘叶片总RNA提取方法,先后尝试了异硫氰酸胍法、Trizol试剂法和热酚法,最终确定采用热酚法,并用LiCl沉淀的方法从柑橘叶片中提取的RNA最完整,DNA、蛋白质和多糖等杂质含量最少。2.参考拟南芥等其它物种中CBF蛋白的保守区域设计了四条简并引物,并筛选出最优的一对引物,用于RT-PCR扩增。结果从枳壳、脐橙和柠檬中各分离出一个CBF同源基因AP2核心区段(柑橘CBFa基因)。并从枳壳中分离出另一个不同的CBF基因AP2核心区段(枳壳CBF1基因)。利用BLAST比对分析发现,这四个CBF片段与其它物种CBF蛋白间具有很高的同源性。脐橙和柠檬CBFa基因AP2区段的序列完全一样,而与枳壳CBFa基因AP2区段存在数个核苷酸位点的差异和一个氨基酸残基的差异。3.依据所分离的两个枳壳CBF基因AP2区段的核苷酸序列,设计分别指向5’和3’端的嵌套特异引物,参考SMART RACE技术,采用巢式PCR分别扩增枳壳CBFa和CBF1基因的5’和3’端。测序验证后,在5’-UTR和3’-UTR区设计引物,PCR扩增获得全长基因,或者采用酶切拼接法获得全长基因。结果成功获得了枳壳CBFa和CBF1基因的全长cDNA。4.利用GeneBank、ExPASy、EMBOSS和Jalview等数据库和软件对所克隆的两个枳壳CBF基因全长cDNA进行全面的生物信息学分析,结果发现枳壳CBFa和CBF1基因都具有CBF特征序列、核定位信号序列、保守的AP2 DNA结合结构域和潜在的酸性结构域。这是所有物种CBF因子的典型结构特征。此外,它们还具有一些其它的特征位点,包括酰基化、酪胺酸硫化和Amidation位点以及一些蛋白激酶磷酸化位点,如蛋白激酶C磷酸化位点和酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点等。推测这些特征位点可能与翻译后加工、活性调节和正常功能的行使有关。
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