当今中国正处于社会转型时期，随着城市化进程的加快，大量农村剩余劳动力纷纷离开乡村来到城市务工、生活，导致流动人口群体规模越来越大。在经济、制度、社会等多重因素下，流动人口生活在城市的“边缘”，成为特殊的社会阶层，没有享受地方政府和社会的平等对待，其权利经常受到侵害。在深入落实科学发展观、大力构建社会主义和谐社会的进程中，流动人口权利保护问题已经引起高层重视和全社会的关注。选举是人民通过投票方式选择利益代表和国家公职人员的活动，是实现“人民主权”的重要环节。按照我国《选举法》的规则设定以及选举实践中的非规范化操作，流动人口选举权的行使和被选举权的实现陷入了层层困境并导致与选举制度产生了强烈的冲突和矛盾，给制度体系及其运作带来了新的问题，而且直接影响到选举的结果和质量。本文从流动人口的选举困境入手，从多个层面分析了其给选举制度带来的冲击与挑战，深入探究了造成上述问题的成因，并在此基础上探索解决问题的对策。