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从2004．6-2005．6年四川省内各规模化大型猪场出现的流产死胎14头中，通过PCR检测出2头为阳性，并从中成功的分离到两株伪狂犬病病毒株，将其分别命名为SS株和SQ株。将所有的毒株连同四川农业大学动物生物技术中心保存Fa株、疫苗株783株、Bartha株和SA215株，四川野毒株SN株、SL株和SCZ株，以及由韶关学院英东生物工程学院娄高明教授惠赠的北京株BJ株、广东株DG、湖北株HS株共计12株伪狂犬病病毒株，应用PCR技术扩增得到了PRV完整的gD基因的片段12条。回收PCR产物，成功连接转化到感受态细胞E．coli DH5a中，并通过菌落PCR和酶切鉴定正确后测序。 将所的12条序列连同GenBank中登录的9条gD基因全序列共21条基因序列，使用生物软件对它们的基因序列的同源性、突变区域的定位、遗传进化关系、酶切位点的差异、密码子偏爱性，氨基酸序列的同源性、蛋白质亲水性、抗原表位分析、二级结构、三级结构预测等生物信息学的内容进行预测和分析。结果表明：PRV-gD基因的开放阅读框的核苷酸长度在1197～1215nt之间，氨基酸长度在399～405个之间，核酸同源性在97.3％-100％之间，氨基酸的同源性在89.8％-98.8％之间，在核酸820-837位有个高变重复区，不同毒株基因均对GC极为偏爱。在遗传进化关系上将我国PRV流行分为四川、华北、东南三个区域。毒株间基因内酶切位点、蛋白质亲水性、抗原表位和蛋白质高级结构预测等内容的分析结果十分相似，说明PRV-gD基因具有很高的保守性。该研究从病原、分子水平、生物信息等方面对PRV-gD基因进行了研究，对于PRV的流行病学研究及诊断和防治具有重要意义。