农业可持续发展的核心是在不断提高土地生产力的同时，不断提高生态环境质量。本论文以长期定位(1987～2005年)于三江平原的白浆土为基本材料，采用田间试验和室内分析相结合的方法，研究了施肥措施、耕作方式和种植制度对大豆田土壤微生物的数量、区系结构、致病镰孢菌及大豆产量的影响，结果表明： 1.施有机肥、秸秆还田及常规耕翻有助于提高土壤中有益微生物的比例，降低致病镰孢菌的比例，从而减轻大豆根腐病的发生。长期单施化肥导致土壤真菌总量增多，不利于土壤微生态系统的良性发展。 2.不同种植制度对土壤微生物区系结构有较大影响。多年连作后土壤中的细菌、放线菌数量降低，真菌数量增加，大豆根际出现致病镰孢菌富集现象，尤以致病力强的种的数量增加明显，导致土壤微生态环境恶化，不利于培肥地力及大豆的生长发育，轮作田各处理有减轻根腐病的趋势。 3.不同农业措施对大豆根腐病的发生有一定影响。无论轮作区还是连作区，除化肥处理外，其他处理的大豆根腐病均有减轻的趋势；轮作与连作相比，各处理的病情指数均有降低趋势。 4.不同作物前茬对土壤微生物数量有一定影响。在轮作体系中，小麦茬比玉米茬更有利于大豆田土壤细菌的繁殖，而玉米茬则比小麦茬更有利于土壤放线菌的繁殖，且与小麦茬相比，玉米茬更有利于控制大豆田真菌的数量，改善土壤的生态环境，减少有害真菌对大豆的危害；多年连作大豆田土壤中细菌和放线菌数量显著下降，有害真菌数量明显增加，不利于培肥地力及大豆的生长发育。 5.不同农业措施对大豆产量有极显著影响。长期施有机肥大豆产量显著优于化肥和秸秆还田，对照产量最低；三种耕法中，常规耕翻显著高于深松，深松又优于免耕；轮作区产量明显高于连作区。