牦牛由于天然放牧自然交配的生产方式，导致牦牛亲缘关系确定难度很大，因而增加了系谱记录，遗传评定，良种推广，品种选育等年工作的难度。本研　　究采用微卫星标记的方法对牦牛亲缘关系检测进行了研究，以期达到完善牦牛在良种推广中的系谱记录的目的，促进牦牛遗传选育获得最大遗传进展，为牦牛亲缘关系鉴定方法的建立提供依据。系谱信息在牛遗传育种中具有很重要的意义，本试验利用PCR技术和全自动毛细血管电泳法技术检测牦牛BM1818、CSSM66、TGLA53、ETH10、TGLA126、INRA037、ILSTS006、ILST0013、ETH225等9个STR基因座的多态性分布，并采用软件Cervus3.0计算该9个基因座的基因频率（Pi）、杂合度（H）和多态信息含量（PIC）等值。研究结果如下：　　1．本试验初步确定了9个微卫星标记作为牦牛微卫星亲子鉴定体系的标记组合：ETH225、ETH10、ILSTS006、INRA037、BM1818、CSSM66、TGLA53、TGLA126、ILST0013。　　2.本试验9个微卫星该标记组合的期望杂合度、等位基因数、多态信息含量的平均值分别为：0.794、11、0.7202。统计各微卫星基因座的等位基因频率，两种情况下累计排除概率分别为：99.99％、99.71，说明该微卫星标记组合在本群体中具有较高的鉴定效率。　　3.9个STR基因座可用于牦牛的遗传连锁分析、个体识别和亲子鉴定等研究领域。