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基因交互是一个极其重要而又复杂的概念.传统上定义基因交互效应为单个基因主效应的统计残差,这被称为统计交互,统计交互最大的缺点是缺乏生物学上的解释,而且检验的功效比较低.
Zhaoetal.(2006)提出了两个不连锁位点的新的交互定义,使其在生物上有一定的解释.
本文把这个定义推广到连锁的情形,并且用Yinetal.(2007)提出的异质性检验统计量进行检验.在全基因组研究中,我们用两步法来检验基因交互,即先检验位点的主效应是否显著,然后再检验那些主效应显著的位点的交互作用。