幽门螺杆菌可塑区基因jhp0933编码蛋白的晶体结构和功能研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:IBMWiki
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)基因组中存在一类低GC含量(35%,远低于HP的39%平均含量)并含有较多插入序列的基因群,被称为可塑区基因(plasiticity region genes)。由于可塑区基因包含了近50%的菌株特异性基因,被认为可能在HP的致病中发挥了重要作用。jhp0933基因是HP可塑区基因的一员,其编码蛋白为假想蛋白,含267个氨基酸,其保守区位于21至185氨基酸之间,可能属于核苷酸转移酶超家族,但具体生物学功能尚不清楚。第一部分,克隆jhp0933全长基因片段、表达并纯化获得JHP933重组蛋白,座滴气相扩散法生长JHP933蛋白晶体,单波长反常散射法(Se-SAD)获得分辨率为2.1?的JHP933蛋白三维结构。根据三维结构,推断JHP933蛋白是核苷酸转移酶超家族的一个新成员,具有核苷酸转移酶超家族的共同结构特征即呈αβαβαβα折叠结构。通过空间结构相似性比对发现,JHP933蛋白的N端核心结构域(11至170氨基酸)与同属核苷酸转移酶超家族的林可酰胺类抗生素耐药相关蛋白Lin A的空间结构高度相似,推测JHP933蛋白也可能具有钝化林可酰胺类抗生素的功能。同时,借助与Lin B复合物的结构比对和叠合,指出了JHP933蛋白上与NTPs及二价金属离子结合的潜在活性位点。第二部分,首先应用PCR技术检测分离自不同消化性疾病的幽门螺杆菌jhp0933,以期了解jhp0933基因的分布情况。对133株HP临床分离株的检测结果显示:jhp0933基因在分离自胃炎、消化性溃疡及胃癌患者HP中的检出率分别为58.7%,54.9%及84.2%,胃炎组、消化性溃疡组的jhp0933基因频率显著低于胃癌组(P<0.05);通过RT-PCR技术证实了jhp0933基因在m RNA水平有表达。为了证实上述结构分析所推测的JHP933蛋白功能,应用DNA同源重组技术成功构建了jhp0933基因缺失的HPJ99突变株;通过克林霉素药敏试验,比对jhp0933基因阳性和阴性临床分离株,以及HPJ99野生株与jhp0933基因缺失株之间的药敏结果,结果未证实JHP933蛋白是林可酰胺类抗生素耐药相关蛋白的推测。应用等温滴定量热法(ITC)验证JHP933蛋白与NTPs(包括ATP、GTP、CTP、TTP和UTP)的相互作用,证实了JHP933蛋白与UTP特异性结合,为JHP933蛋白的酶作用底物的筛选和最终确定提供了有价值的依据。结论:1.经JHP933蛋白三维结构解析,确定幽门螺杆菌JHP933蛋白为核苷酸转移酶超家族的新成员。2.JHP933蛋白存在与NTPs及二价金属离子结合的潜在活性位点,JHP933蛋白可与UTP特异性结合。3.JHP933蛋白N端核心结构域与林可酰胺类耐药蛋白Lin A空间结构高度相似,但药敏试验未能证实其与林可酰胺类耐药蛋白相关。4.从m RNA水平证实jhp0933基因能够表达。jhp0933基因在HP临床分离株的阳性率为60.9%,分离自胃癌患者HP的阳性率显著高于胃炎和消化性溃患者。
其他文献
MBL属于C型凝集素超家族中胶凝素(collectins)家族成员,是肝细胞分泌的血浆蛋白,对于抗御病原体感染和清除凋亡细胞及免疫复合物具有重要意义。我们近期研究发现MBL可调节人
2004年12月1日是中国人民银行成立56周年暨履行中央银行职能20周年纪念日,回顾人民银行走过的发展道路,成就辉煌。
考虑到高职院校的办学特色,针对高职学生的特点。以系教研室为单位,课题组具体实施,营造浓厚的研究氛围,加强学生对理论知识学习、理解,结合教学实际,紧密围绕当前教改的前沿
<正> 十届全国人大一次会议和政协十届一次会议刚刚在北京胜利闭幕。 “两会”描绘了国家发展的宏伟蓝图,为我国加快建设现代化奠定了坚实的基础。 金融话题素来是“两会”代
<正>达沙替尼为第2代酪氨酸激酶抑制剂,适用于对包括伊马替尼在内的治疗方案耐药不能耐受的慢性粒细胞白血病所有病期成人患者。近年来国内有文献报道其不良反应,现概述如下
主要阐述了广西交通职业技术学院在汽车后市场进行的“订单式”人才培养的探索与实践。