本实验以内蒙古地区猪瘟阳性病料的脾脏和猪瘟C株细胞毒为材料,提取细胞RNA,根据已报道的猪瘟病毒基因组序列设计合成引物,应用RT-PCR技术和nPCR技术,分别扩增出内蒙古猪瘟野株与猪瘟C株疫苗毒的E2基因,然后将它们克隆于PMD18-T载体中,并进行核苷酸序列测定。用DNAstar软件分析了内蒙古猪瘟流行株与当前普遍使用的猪瘟兔化弱毒疫苗株E2基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列,并绘制遗传进化树,以了解内蒙古猪瘟野毒主要保护性抗原与疫苗之间的变异情况,从而为内蒙古地区猪瘟的防治提供分子流行病学资料。结果如下: 1.所测内蒙古野毒株与猪瘟C株细胞毒的保护性抗原基因E2序列全长为1170bp,包含有全部信号肽序列和部分跨膜结构序列。 2.对目的基因进行序列测定后与国内外其他毒株进行核苷酸序列和氨基酸序列比较分析,结果显示内蒙古野毒NMFL株与当前使用的疫苗株(C株细胞毒)的保护性抗原基因E2的核苷酸和氨基酸序列的同源性较低,分别为82.6%和87.9%。 3. 通过把内蒙古野毒株与当前使用的疫苗株(C株细胞毒) 、国内外其他毒株E2基因的主要编码区建立遗传进化树,结果显示,内蒙古野毒NMFL株与C株细胞毒亲源关系较远,分别属于不同的基因群。内蒙古野毒NMFL株与国内其他毒株的亲源关系较近,同属于基因Ⅱ型,而C株细胞毒和石门强毒同属于基因Ⅰ型。