随着我国畜禽养殖业规模化程度的提高,畜禽养殖污染问题凸显,现已成为我国最主要的农业污染源,畜禽养殖污染治理刻不容缓。本文针对目前规模养殖业存在的废弃物环境污染问题,利用系统动力学方法和演化博弈理论,对规模养殖企业、地方政府、下游农户的行为演化进行研究。首先对三者组成的博弈演化模型进行了分析,并用系统动力学模型对演化过程进行了模拟,结果表明三方博弈不存在稳定均衡点;其次,通过已有文献的研究和对模型的分析,提出了优化的动态奖励惩罚措施,该措施使得政府对完全治污企业的奖励、政府对不完全治污企业的罚款、企业对农户损失的赔偿都与企业完全治污的概率相关,该措施重视奖励给企业的引导效用和受损失农户的经济补偿,并利用系统动力学模型再次进行模拟,结果表明,优化后的三者博弈演化过程中的波动不仅得到有效抑制而且向理想的稳定均衡点演化,然后对系统动力学模型进行参数调控,研究发现同时提高政府对完全治污企业的奖励、政府对不完全治污企业的罚款、企业对农户的赔偿可以使博弈系统演化收敛于更理想状态,而且降低企业完全治污成本可以使优化结果更理想,降低农户举报企业所需成本不会提高企业完全治污概率,但可以缩短博弈达到稳定均衡点的时间,提高农户举报企业政府给予的奖励不会对博弈产生影响;最后,本文基于江西省生猪规模养殖污染现实情况,提出更有针对性和更具体的政策建议。