“中国制造2025”以智能制造作为未来的主要方向,并且明确定义了制造业的9大主要任务,这给制造业转型升级带来了新的机遇和挑战。十九大报告提出,创新不仅是引领发展的主要驱动力,也是构建现代化经济体系的关键战略支撑。但改革开放几十年来,粗放型的发展方式使得我国环境问题日益严峻,严重制约了制造业的发展。中国在全球竞争中地位较低,制造业也一直处在全球价值链低端,调整当前制造业结构对于改变国际地位尤为重要。绿色技术创新作为经济发展和环境保护两者之间冲突的重要手段,会对我国制造业的发展产生一定影响。在这种背景下,研究绿色技术创新与制造业转型之间的关系就非常重要且有价值,可以为国家和地方政府提供适当的政策参考。首先,本文在国内外现有研究的基础上,对制造业转型升级的内涵进行了界定,认为制造业的转型升级可以界定为制造业结构“清洁化”转型。并在理论基础之上,本文通过把绿色技术创新划分为两种衡量指标,研究对制造业转型升级的影响。其次,从污染排放强度出发,区分出我国制造业中的清洁产业,构建了制造业结构“清洁化”转型指标。最后,结合我国2013-2016年的31个省市(区)的相关数据,利用面板数据模型实证检验了两种绿色技术创新衡量指标对制造业转型升级的影响分析。研究结果表明,绿色技术创新对制造业转型升级产生先抑制后促进的“U”型作用,说明绿色技术创新对于制造业结构清洁化转型的影响是非线性的。东部地区的绿色技术创新对制造业转型升级表现出较为显著的“U”型效应,而中部和西部地区的绿色技术创新投入给制造业转型升级带来先抑制后促进的影响。最后根据实证结果,提出绿色技术创新促进制造业转型升级的对策。