少棘蜈蚣线粒体基因组全序列和平耳孔蜈蚣的地理种群遗传变异分析

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:luzb2009
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本论文包括三部分: 第一章:多足动物线粒体基因组和地理种群遗传变异分析的研究进展。 第二章:补齐少棘蜈蚣线粒体基因组全序列。 采用、长片断扩增和PCR引物步移测序等方法,补齐少棘蜈蚣(Scolopendra multilan)线粒体基因组全序列,主要结果如下: (1)序列全长为13,734 bp,其基因组成和顺序、基因的方向即编码链的选择、碱基G的低含量和对碱基A偏好以及GC和AT偏斜与已知的多足动物线粒体基因组相同。 (2)蛋白质编码基因的终止密码子只有TAG和TAA2种,与其它多足动物不同。 (3)基因组中出现了较多的基因重叠区域。 (4)基因排列顺序与石蜈蚣最为相似,二者之间仅有1个tRNA基因的位置发生重排。 第三章:用线粒体cob基因部分序列探讨中国平耳孔蜈蚣地理种群的遗传变异。对五个种群11个样地58个平耳孔蜈蚣个体的cob基因部分序列变异分析,共定义26个单元型。基于单元型构建ML和Bayesian系统发生树,各样地平耳孔蜈蚣的单元型呈现一种混杂的分布格局。TCS网络图和最小跨度网络图(MSN)显示了单元型之间的最小突变步数,分析显示出现了多处祖先单元型(HB1,SHY1,SYC1,SYC2,SJZ1),并且其它单元型以祖先单元型为中心呈星状辐射排列。种群的遗传多样性波动范围比较大,单元型多样度(h)范围为0~1.000;核苷酸多样性指数(x)介于0~0.18162之间。根据节肢动物分子钟,推断现代平耳孔蜈蚣遗传分布格局中,现代平耳孔蜈蚣遗传分布格局比较古老,早在第三纪中期就已经形成,可见更新世的冰期对蜈蚣没有影响,因为在冰期之前它们就已经开始分化了,所以表现出多个祖先单元型。从五个种群的分歧时间我们可以看出,华南种群和华中种群为古老的平耳孔蜈蚣种群,而东北种群和华北种群黄淮平原亚区为较现代的种群,形成这样的分布格局也体现了动物对温度的适应性。
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