白桦遗传图谱的构建及生长性状QTL定位

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaowangdoc
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白桦(Betula platyphylla Suk.)是我国东北与内蒙古林区的先锋树种之一,是优良的阔叶用材树种。为了加速白桦性状,如生长、材质和材性等遗传改良进程,有必要构建白桦遗传图谱并对上述性状进行定位,从而为辅助选择育种奠定基础。为此,本文进行了以下研究:(1)通过对白桦强化种子园内32株白桦纤维长度测定,选择出纤维长度大于均值加1个标准差的个体为父本和纤维长度小于均值减1个标准差的个体为母本进行控制杂交,从而选择80个F1代进行分子连锁图谱构建。(2)以父母本为材料,从1,200个RAPD引物中筛选出223个多态性引物,从330对SSR引物中筛选出27对多态性引物;利用选择的RAPD和SSR多态性引物,对父母本和80株白桦F1子代扩增,共获得415个RAPD多态位点和70个SSR多态位点。χ2检验表明410个位点符合1:1分离、45个位点符合3:1分离、30个位点属偏分离。(3)“拟测交”分表表明,410个符合1:1分离位点中,203个位点来自父本,有207个位点来自母本。分别利用MapMaker3.0和MapDrawt2.1构建和绘制图谱,父本203个连锁标记构成了16个不同的连锁群(4个以上标记),6个三联体和8个连锁对,连锁标记覆盖的总图距为1,402.4cM(centimorgan),平均图距13.1cM;母本207个标记构成了17个连锁群(4个以上标记),5个三连体和9个连锁对,连锁标记覆盖的总图距为1,440.7cM(centimorgan),平均图距12.5cM。(4)利用Windows QTL Cart 2.5软件的复合区间作图法对白桦苗期苗高、地径等性状进行全基因组扫描,在LOD≥2.0的条件下,发现2个与苗高相关的QTL、6个与地径相关的QTL。其中,父本连锁群体中定位1个与苗高相关QTL,其加性效应为-5.57、贡献率为9.76%,1个与地径相关QTL,其加性效应为0.04、贡献率为17.54%;母本连锁群体中定位1个与苗高相关的QTL,其加性效应为-6.14、贡献率为12.54%,5个与地径相关的QTL,其加性效应分别为0.03、0.16、0.15、0.05、-0.25,贡献率分别为9.12%、16.01%、16.72%、18.94%、19.84%。
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