海南黎族人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶SNP分析

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研究目的: 国内外大量研究表明,葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因发生单核苷酸突变而导致的氨基酸取代是葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的主要原因。其突变类型有明显的地区性。在非洲,特别是撒哈拉以南地区,低活性G6PD等位基因主要是G6PD A-;地中海和中东地区主要为G6PD Med变型;而中国人群中导致患G6PD缺乏症的十多种G6PD变型中以G1376T和G1388A为主要的变异型。本研究在DNA水平对海南黎族人群G6PD基因的多态性位点进行进一步的分析,以确定海南黎族G6PD基因的分子特征。 研究方法: 采用NBT定量法筛查海南黎族人群中的G6PD缺乏者;采用扩增阻碍突变系统法对患G6PD缺乏症的男性患者进行G6PD突变位点G1376T和G1388A的筛查;运用生物信息学软件分析G6PD基因部分区域的测序结果;毛细管电泳对G6PD下游19kb区的三个微卫星位点进行电泳分析,分析检验其与G6PD多态性位点的连锁情况。 研究结果: 1.在714例海南籍男性黎族人中有86例G6PD缺乏症患者,发病率为12.05%。 2.随机抽取G6PD缺乏样本50例测序。用ARMS法检测发现G6PD G1376T 27例(54.0%),G6PD G1388A 12例(24.0%)。 3.随机抽取G6PD正常海南黎族、汉族男性各50例作为50例海南黎族G6PD缺乏症男性患者的对照。测序得到下列结果: (1)在海南黎族G6PD缺乏样本中,除了27例G1376T变型和12例G1388A变型以外,还发现有3例G6PD cDNA第1311位C突变为T(C1311T),它们全部都伴有IVS-11T93C突变,即C1311T/IVS-11T93C复合突变。 (2)在海南黎族G6PD正常样本中,发现有12例C131lT/IVS-11T93C复合突变。(3)在海南汉族G6PD正常样本中,发现有5例C1311T/IVS-11T93C复合突变。 (4)海南汉族、黎族G6PD正常样本中各发现两例G6PD内含子5第636或637位核苷酸T缺失(IVS-5 636or637 T del)。 4.对上述150例样本进行G6PD下游三个微卫星分型。观察到 G6PD A1376T突变与172bp的微卫星(AC)n连锁,G6PD C1311T/IVS-11T93C复合突变与176bp的微卫星(AC)n连锁。 结论: 研究结果表明海南黎族人群G6PD基因最常见的突变型是G1376T和G1388A;同义突变 C1311T与IVS-11T93C在不同种族人群中均显示出强连锁,它们可能有共同的祖先;而 IVS-5 636or637 T del在G6PD正常于缺乏的群体中均有出现,提示其可能不是导致酶缺乏的关键位点。G6PD G1376T可能由172bp的(AC)n分化枝进化而来。G6PD C1311T/IVS-11T93C复合突变可能由176bp的(AC)n分化枝进化而来。
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